94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4197 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  42.13 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  41.14 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  40.93 
 
 		 440 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  35.32 
 
 		 435 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  36.49 
 
 		 422 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  40.34 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  34.73 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  35.92 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  35.4 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  36.6 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  36.44 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  37.73 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  32.48 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  35.78 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  31.35 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  34.3 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  30.77 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  32.9 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  33.01 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  32.79 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  31.76 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  31.87 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  32.35 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  29.22 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  24.63 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  29.89 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  30.71 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 639 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  21.56 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  21.56 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  27.27 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  32.19 
 
 		 638 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  31.01 
 
 		 651 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.25 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  26.73 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  30.88 
 
 		 634 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  26.73 
 
 		 587 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  30.37 
 
 		 629 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 726 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  31.43 
 
 		 630 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  26.9 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  27.03 
 
 		 697 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  27.86 
 
 		 624 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 596 aa  50.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  27.89 
 
 		 690 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  30.11 
 
 		 689 aa  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  31.49 
 
 		 640 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  34.27 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  30 
 
 		 681 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  25.35 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  25.39 
 
 		 662 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  31.45 
 
 		 693 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  29.14 
 
 		 718 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  26.79 
 
 		 708 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  23.85 
 
 		 632 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  29.25 
 
 		 691 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4464  hypothetical protein  27.59 
 
 		 735 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  31.85 
 
 		 628 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  28.89 
 
 		 663 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  27.89 
 
 		 667 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  30.68 
 
 		 704 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  31.85 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  28.29 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  31.39 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  31.39 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  31.17 
 
 		 619 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  39.02 
 
 		 733 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  32.45 
 
 		 702 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  28.67 
 
 		 672 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  28.86 
 
 		 672 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 686 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 680 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  39.02 
 
 		 733 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  31.48 
 
 		 696 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 		 694 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  29.37 
 
 		 715 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  27.33 
 
 		 699 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  27.33 
 
 		 699 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  28.29 
 
 		 694 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  26.58 
 
 		 755 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  27.5 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 699 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  28.03 
 
 		 689 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  27.59 
 
 		 690 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  31.34 
 
 		 642 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  28.87 
 
 		 744 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  26.58 
 
 		 684 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  30.82 
 
 		 738 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  27.81 
 
 		 736 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  21.3 
 
 		 642 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  28.57 
 
 		 674 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  24.55 
 
 		 685 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>