65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1243 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  906    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  57.46 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  57.17 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  50 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  45.93 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  43.07 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  42.79 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  41.65 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  39.14 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  36.6 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  34.14 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  38.44 
 
 		 499 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  28.91 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  31.42 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  30.28 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  27.13 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  28.94 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  29.43 
 
 		 383 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  29.28 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  28.73 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  27 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  23.93 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  26.35 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  25.22 
 
 		 587 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  31.34 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  30.18 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  23.79 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  23.69 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  24.3 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  24.5 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  25.79 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  24.74 
 
 		 624 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  24.93 
 
 		 651 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  25.53 
 
 		 628 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  30.5 
 
 		 634 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  22.68 
 
 		 632 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  24.58 
 
 		 638 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  23.58 
 
 		 593 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  24.93 
 
 		 640 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  30.77 
 
 		 638 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.64 
 
 		 593 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  31.85 
 
 		 693 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  23.77 
 
 		 695 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  23.61 
 
 		 697 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  31.9 
 
 		 630 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  28.73 
 
 		 625 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  32.79 
 
 		 718 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  29.06 
 
 		 786 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.42 
 
 		 593 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  24.55 
 
 		 624 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 639 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  30.3 
 
 		 663 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  31.62 
 
 		 455 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  25.21 
 
 		 612 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  31.62 
 
 		 587 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  24.02 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  27.61 
 
 		 633 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  29.41 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  24.21 
 
 		 658 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  24.45 
 
 		 726 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  27.61 
 
 		 659 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  28.57 
 
 		 630 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>