61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0494 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  81.14 
 
 		 386 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  68.91 
 
 		 383 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  64.6 
 
 		 389 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  70.21 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  59.59 
 
 		 383 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  61.14 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  58.16 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  57.62 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  48.4 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  40.89 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  33.11 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  30.75 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  32.36 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  30.91 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  30.93 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  30.93 
 
 		 587 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  31.57 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  30.54 
 
 		 471 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  28.35 
 
 		 461 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  32.12 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  28.14 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 		 504 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  26.86 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  30.06 
 
 		 630 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 		 494 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  28.71 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  26.67 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  30.3 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  25 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  28.46 
 
 		 624 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  29.45 
 
 		 739 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 		 633 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  29.23 
 
 		 625 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  29.91 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  30.41 
 
 		 628 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  27.21 
 
 		 674 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  26.92 
 
 		 612 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  30.41 
 
 		 640 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  19.76 
 
 		 593 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  43.48 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  19.76 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.32 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  30.95 
 
 		 663 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  30.77 
 
 		 628 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  26.12 
 
 		 693 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  23.58 
 
 		 641 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  24.41 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  28.21 
 
 		 715 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.91 
 
 		 632 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  29.66 
 
 		 662 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5068  protein of unknown function DUF839  24.76 
 
 		 463 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762163 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  27.5 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  26.15 
 
 		 634 aa  43.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  26.98 
 
 		 624 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  23.33 
 
 		 619 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 		 627 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  27.56 
 
 		 638 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>