37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5068 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5068  protein of unknown function DUF839  100 
 
 
463 aa  929    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  58.17 
 
 
462 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  32.4 
 
 
442 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  27.34 
 
 
440 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  23.68 
 
 
674 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.36 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  25.16 
 
 
499 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  23.53 
 
 
633 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  22.46 
 
 
663 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  24.49 
 
 
642 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0490  hypothetical protein  44.93 
 
 
193 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3461  CHRD domain containing protein  58.82 
 
 
211 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.664498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4130  C-type lectin domain protein  63.16 
 
 
186 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  21.93 
 
 
658 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4091  C-type lectin domain protein  63.16 
 
 
186 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3873  hypothetical protein  84.62 
 
 
224 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3823  hypothetical protein  84.62 
 
 
224 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  30.92 
 
 
560 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0556  protein of unknown function DUF1555  36.54 
 
 
246 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3228  hypothetical protein  60 
 
 
209 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  21.69 
 
 
674 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4922  hypothetical protein  41.43 
 
 
173 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  28.48 
 
 
587 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  26.73 
 
 
738 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  23.89 
 
 
667 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  23.97 
 
 
739 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  24.28 
 
 
458 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  26.96 
 
 
641 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4305  hypothetical protein  73.08 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  26.51 
 
 
715 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  21.18 
 
 
629 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4419  coagulation factor 5/8 type domain protein  58.82 
 
 
229 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4757  hypothetical protein  63.33 
 
 
251 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0651  hypothetical protein  60 
 
 
239 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.66973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  25.83 
 
 
386 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  24.76 
 
 
386 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  41.54 
 
 
494 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>