85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1423 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  100 
 
 		 442 aa  900    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5068  protein of unknown function DUF839  32.4 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  31.1 
 
 		 462 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  26.09 
 
 		 674 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  27.01 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  27.95 
 
 		 689 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  25.83 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 694 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  23.3 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 		 658 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  27.96 
 
 		 715 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  26.33 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  26.32 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  26.9 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  27.16 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  28.16 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  26.86 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  27.18 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  26.74 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 596 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  26.71 
 
 		 663 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  26.93 
 
 		 689 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  27.12 
 
 		 694 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  26.74 
 
 		 739 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  26.28 
 
 		 718 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  23.27 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  26.28 
 
 		 628 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  28.75 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  23.84 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 627 aa  54.3  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  26.95 
 
 		 628 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  27.32 
 
 		 630 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  26.15 
 
 		 674 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  23.84 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  27.21 
 
 		 640 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  25.52 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  25.66 
 
 		 708 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  27.08 
 
 		 667 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 686 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  28.24 
 
 		 663 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  26.18 
 
 		 662 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  27.3 
 
 		 663 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  26.3 
 
 		 593 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  24.88 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  27.81 
 
 		 647 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  23.96 
 
 		 377 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  28.38 
 
 		 647 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  28.01 
 
 		 641 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  25 
 
 		 560 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  24.07 
 
 		 702 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  25.87 
 
 		 704 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  26.3 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  26.5 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  24.6 
 
 		 642 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  23.94 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  26.09 
 
 		 667 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  26.3 
 
 		 593 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  24.49 
 
 		 678 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  25.58 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  25.95 
 
 		 821 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  27.4 
 
 		 659 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  27.4 
 
 		 659 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  26.09 
 
 		 629 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  25.45 
 
 		 672 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  25.6 
 
 		 687 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25.73 
 
 		 633 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3454  protein of unknown function DUF839  29.76 
 
 		 768 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0370707  normal  0.136253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  27.47 
 
 		 736 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 		 733 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  25.89 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4464  hypothetical protein  24.43 
 
 		 735 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  23.15 
 
 		 686 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  25.91 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  25.53 
 
 		 690 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  24.4 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  27.52 
 
 		 702 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  25.63 
 
 		 672 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 		 685 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 		 685 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  25.5 
 
 		 631 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  25.14 
 
 		 728 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4941  protein of unknown function DUF839  25.12 
 
 		 751 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>