110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3386 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  100 
 
 
476 aa  986    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  27.72 
 
 
651 aa  90.1  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 
633 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  26.3 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  24.4 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
596 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  25.7 
 
 
662 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 
639 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  25.54 
 
 
687 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  25.63 
 
 
744 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  24.18 
 
 
630 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  24.6 
 
 
632 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  30.73 
 
 
626 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  26.17 
 
 
624 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  27.1 
 
 
442 aa  63.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  25.08 
 
 
681 aa  63.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  23.15 
 
 
697 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.2 
 
 
612 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  23.71 
 
 
678 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  25.39 
 
 
667 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  32.37 
 
 
631 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  24.85 
 
 
638 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  31.11 
 
 
625 aa  60.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  24.48 
 
 
726 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  24.91 
 
 
653 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  24.71 
 
 
672 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  24.91 
 
 
653 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  24.91 
 
 
653 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  24.17 
 
 
624 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  23.98 
 
 
669 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  21.63 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  35.05 
 
 
630 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  26.12 
 
 
662 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  23.93 
 
 
653 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  26.4 
 
 
638 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  36.46 
 
 
607 aa  58.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  23.93 
 
 
653 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  23.93 
 
 
653 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  23.93 
 
 
653 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  24.65 
 
 
755 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  25.09 
 
 
653 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  28.48 
 
 
688 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  32.84 
 
 
630 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  24.5 
 
 
445 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  23.26 
 
 
642 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  24.02 
 
 
672 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  23.74 
 
 
736 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  26.14 
 
 
667 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  31.58 
 
 
650 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  23.86 
 
 
640 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1725  twin-arginine translocation pathway signal  23.68 
 
 
764 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  24.82 
 
 
593 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  22.98 
 
 
708 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  23.58 
 
 
629 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  30.08 
 
 
650 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  26.33 
 
 
695 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  25.11 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  24.18 
 
 
628 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  24.66 
 
 
753 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  24.1 
 
 
628 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  24.92 
 
 
593 aa  53.9  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  23.91 
 
 
702 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  29.94 
 
 
583 aa  53.9  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  22.22 
 
 
440 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  24.62 
 
 
593 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  22.91 
 
 
698 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  33.93 
 
 
786 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  28.89 
 
 
651 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  25.19 
 
 
631 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  25.2 
 
 
739 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  22.97 
 
 
741 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  23.13 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  24.76 
 
 
625 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  27.39 
 
 
494 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  25.38 
 
 
651 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  35.07 
 
 
587 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  22.53 
 
 
694 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  24.9 
 
 
653 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  23.51 
 
 
634 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  23.12 
 
 
687 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  22.8 
 
 
826 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  28.57 
 
 
651 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  22.08 
 
 
663 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  28.57 
 
 
654 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  28.57 
 
 
652 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  27.94 
 
 
673 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  24.51 
 
 
678 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  24.51 
 
 
678 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  22.85 
 
 
715 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  28.68 
 
 
650 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  27.82 
 
 
654 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  31.72 
 
 
693 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  23 
 
 
658 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  25.58 
 
 
442 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  28.7 
 
 
663 aa  47.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  22.33 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  25.77 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  30.67 
 
 
641 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 
648 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  30.77 
 
 
818 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>