169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01228 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  60.54 
 
 
631 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  100 
 
 
624 aa  1269    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  87.82 
 
 
612 aa  1103    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  38.6 
 
 
626 aa  361  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  32.44 
 
 
884 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  31.31 
 
 
883 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  30.1 
 
 
887 aa  247  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  29.8 
 
 
583 aa  169  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  33.11 
 
 
625 aa  169  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  31.31 
 
 
630 aa  156  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  27.27 
 
 
607 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 
648 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  29.48 
 
 
653 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  30.3 
 
 
654 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  30.3 
 
 
654 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  30.3 
 
 
651 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  30.3 
 
 
652 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  30.07 
 
 
678 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  30.07 
 
 
678 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  27.29 
 
 
630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  29.49 
 
 
653 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  28.67 
 
 
631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  29 
 
 
673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  28.15 
 
 
688 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  27.98 
 
 
653 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  28.21 
 
 
653 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  27.98 
 
 
653 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  28.57 
 
 
662 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  29.05 
 
 
650 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  29.25 
 
 
678 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  27.75 
 
 
653 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  27.75 
 
 
653 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  27.75 
 
 
653 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  27.75 
 
 
653 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  27.78 
 
 
650 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  27.29 
 
 
650 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  26.46 
 
 
623 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  28.27 
 
 
651 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  30 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  29.92 
 
 
560 aa  72  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  31.71 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  29.72 
 
 
696 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  31.55 
 
 
629 aa  70.5  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  30.27 
 
 
633 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  31.05 
 
 
674 aa  68.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  31.41 
 
 
638 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  29.1 
 
 
383 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  34.81 
 
 
632 aa  65.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  30.69 
 
 
663 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  28.5 
 
 
587 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  26.17 
 
 
476 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  28.11 
 
 
715 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  31.84 
 
 
647 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  31.02 
 
 
634 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  31.96 
 
 
630 aa  61.6  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  29.21 
 
 
593 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  30.43 
 
 
642 aa  61.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  34.09 
 
 
691 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  26.33 
 
 
699 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  28.71 
 
 
593 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  26.23 
 
 
672 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 
686 aa  60.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  28.5 
 
 
642 aa  60.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  32.69 
 
 
786 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  28.07 
 
 
702 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  28.78 
 
 
704 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  29.74 
 
 
698 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  31.44 
 
 
624 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  28.22 
 
 
593 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  30.43 
 
 
702 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  28.78 
 
 
695 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  29.71 
 
 
662 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 
680 aa  59.7  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 
596 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  26.45 
 
 
672 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  31.03 
 
 
697 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  33.54 
 
 
674 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  30.91 
 
 
689 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  31.82 
 
 
718 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  32.12 
 
 
689 aa  58.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  26.08 
 
 
699 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  26.08 
 
 
699 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  35.86 
 
 
669 aa  57.4  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  30.05 
 
 
663 aa  57.4  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  29.91 
 
 
677 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  32.61 
 
 
744 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  29.6 
 
 
651 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  31.43 
 
 
690 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  29.29 
 
 
708 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  25.54 
 
 
738 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  31.74 
 
 
689 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  32.75 
 
 
690 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  26.58 
 
 
383 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  23.47 
 
 
386 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  28.04 
 
 
659 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  32.5 
 
 
625 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  33.12 
 
 
694 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  30.39 
 
 
684 aa  55.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  26.89 
 
 
716 aa  55.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>