81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0622 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  58.18 
 
 
688 aa  739    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  78.54 
 
 
652 aa  1054    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  78.26 
 
 
678 aa  1068    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  66.67 
 
 
651 aa  865    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  78.73 
 
 
653 aa  1030    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  77.64 
 
 
653 aa  1045    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  78.11 
 
 
653 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  77.95 
 
 
653 aa  1049    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  77.64 
 
 
653 aa  1045    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  63.58 
 
 
678 aa  818    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  63.93 
 
 
631 aa  850    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  64.95 
 
 
650 aa  870    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  77.76 
 
 
653 aa  1056    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  78.26 
 
 
654 aa  1068    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  78.54 
 
 
651 aa  1074    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  95.08 
 
 
650 aa  1287    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  71.04 
 
 
630 aa  925    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  77.95 
 
 
653 aa  1049    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  78.73 
 
 
653 aa  1057    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  58.48 
 
 
648 aa  740    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  77.95 
 
 
654 aa  1066    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  100 
 
 
650 aa  1339    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  68.3 
 
 
662 aa  894    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  68.42 
 
 
673 aa  899    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  77.64 
 
 
653 aa  1045    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  78.26 
 
 
678 aa  1068    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  42.12 
 
 
623 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  77.87 
 
 
253 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  35.43 
 
 
583 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  36.59 
 
 
630 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  33.09 
 
 
607 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  40.52 
 
 
625 aa  258  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  28.42 
 
 
631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.93 
 
 
626 aa  132  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  27.78 
 
 
624 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.29 
 
 
612 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  31.89 
 
 
883 aa  67  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  25.07 
 
 
884 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  23.81 
 
 
696 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  26.52 
 
 
887 aa  60.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  25.05 
 
 
672 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  34.23 
 
 
739 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  24.63 
 
 
704 aa  57.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  24.51 
 
 
672 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  31.58 
 
 
476 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 
680 aa  56.6  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.05 
 
 
593 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  24.94 
 
 
708 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  27.22 
 
 
593 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  23.19 
 
 
695 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  22.78 
 
 
689 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 
596 aa  53.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  23.53 
 
 
681 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  30.12 
 
 
587 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  26.55 
 
 
458 aa  52.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  23.51 
 
 
677 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  25 
 
 
638 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  24.05 
 
 
662 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.37 
 
 
593 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  23.06 
 
 
667 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  23.98 
 
 
693 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  26.92 
 
 
659 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  30.13 
 
 
632 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  26.03 
 
 
786 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  26.92 
 
 
659 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  26.38 
 
 
663 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  27.47 
 
 
698 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 
658 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  25.49 
 
 
663 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  25.63 
 
 
629 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  29.71 
 
 
689 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  25.85 
 
 
689 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  30.17 
 
 
694 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 
494 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  23.13 
 
 
638 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  27.35 
 
 
383 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  25.4 
 
 
386 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  25.64 
 
 
383 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  28.12 
 
 
715 aa  45.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  26.79 
 
 
821 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  26.47 
 
 
818 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>