111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3454 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3454  protein of unknown function DUF839  100 
 
 
768 aa  1558    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0370707  normal  0.136253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  26.25 
 
 
689 aa  157  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  25.37 
 
 
674 aa  154  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  25.96 
 
 
738 aa  153  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
694 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  29.18 
 
 
669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  30.85 
 
 
702 aa  144  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  26.26 
 
 
680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  27.31 
 
 
689 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  27.94 
 
 
708 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  27.2 
 
 
689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  25.7 
 
 
696 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 
658 aa  130  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  27.41 
 
 
708 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  25.26 
 
 
642 aa  130  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  25.04 
 
 
698 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  27.65 
 
 
704 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  27.13 
 
 
694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  27.07 
 
 
647 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  26.45 
 
 
647 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  27.66 
 
 
628 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  25.11 
 
 
641 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  24.54 
 
 
702 aa  124  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  27.11 
 
 
628 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  26.94 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  29.03 
 
 
691 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  27.87 
 
 
624 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  24.74 
 
 
629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  25.36 
 
 
718 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  29.1 
 
 
715 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  24.78 
 
 
659 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  24.78 
 
 
659 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  23.89 
 
 
587 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  26.4 
 
 
640 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  26.08 
 
 
821 aa  114  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 
639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 
633 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  28.91 
 
 
690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  24.65 
 
 
667 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  23.95 
 
 
695 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  25.16 
 
 
677 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
699 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  26.92 
 
 
699 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  23.76 
 
 
663 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  26.72 
 
 
699 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4941  protein of unknown function DUF839  23.75 
 
 
751 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  27.02 
 
 
690 aa  108  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1067  protein of unknown function DUF839  24.04 
 
 
744 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  27.48 
 
 
638 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  26.62 
 
 
697 aa  106  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  24.96 
 
 
674 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  23.9 
 
 
642 aa  105  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  25.87 
 
 
739 aa  105  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  24.77 
 
 
663 aa  104  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  24.82 
 
 
667 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  27 
 
 
693 aa  103  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  25 
 
 
632 aa  102  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  26.23 
 
 
662 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 
596 aa  101  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  25.7 
 
 
684 aa  101  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.93 
 
 
593 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  25.31 
 
 
672 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  24.59 
 
 
663 aa  98.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  26.79 
 
 
681 aa  99  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  24.25 
 
 
593 aa  98.2  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4464  hypothetical protein  23.11 
 
 
735 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  24.06 
 
 
593 aa  97.4  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3006  hypothetical protein  25.48 
 
 
687 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  23.16 
 
 
685 aa  96.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  24.71 
 
 
651 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  25.59 
 
 
672 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  26.03 
 
 
619 aa  94.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  24.82 
 
 
630 aa  93.2  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 
733 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  23.35 
 
 
818 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2385  hypothetical protein  23.61 
 
 
685 aa  90.5  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  24.75 
 
 
733 aa  90.5  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  24.86 
 
 
786 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  22.42 
 
 
686 aa  89.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2264  hypothetical protein  23.13 
 
 
685 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.258998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  25.11 
 
 
638 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  24.95 
 
 
625 aa  87.8  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1749  hypothetical protein  23.82 
 
 
686 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.624168  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  22.29 
 
 
728 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  24.04 
 
 
744 aa  87.4  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2381  hypothetical protein  22.79 
 
 
685 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0129049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  24.64 
 
 
726 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0589  twin-arginine translocation pathway signal  26.28 
 
 
716 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115541  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  25.29 
 
 
627 aa  85.5  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1942  twin-arginine translocation pathway signal  24.7 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0591004  normal  0.0783573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2034  twin-arginine translocation pathway signal  24.7 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1995  hypothetical protein  23.93 
 
 
685 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.266235  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06725  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  23.56 
 
 
678 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  25.25 
 
 
741 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2951  hypothetical protein  23.98 
 
 
689 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2088  hypothetical protein  22.76 
 
 
685 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2081  protein of unknown function DUF839  22.3 
 
 
685 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281571  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  23 
 
 
755 aa  81.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  23.41 
 
 
678 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  23.41 
 
 
716 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>