28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34208 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  100 
 
 
455 aa  832    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  100 
 
 
587 aa  1216    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  73.39 
 
 
630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  31.83 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  31.71 
 
 
372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  31.46 
 
 
386 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  32.47 
 
 
389 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  31.14 
 
 
377 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  29.47 
 
 
386 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  30.22 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  29.2 
 
 
383 aa  97.1  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  29.74 
 
 
383 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  26.92 
 
 
369 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  27.32 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  24.88 
 
 
422 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  24.94 
 
 
435 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  24.07 
 
 
458 aa  60.8  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  26.73 
 
 
443 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  24.5 
 
 
444 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 
504 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  24.7 
 
 
440 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  24.47 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  33.61 
 
 
484 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  31.62 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  23.79 
 
 
471 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  44.68 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 
494 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  26.42 
 
 
442 aa  44.3  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>