147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0441 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  64.77 
 
 
186 aa  247  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  53.63 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  50.82 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  48.88 
 
 
187 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  47.03 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  48.33 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  44.94 
 
 
193 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  46.29 
 
 
199 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  44 
 
 
182 aa  160  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  43.2 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  37.08 
 
 
187 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  36.21 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  35.06 
 
 
182 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  35.47 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  38.37 
 
 
184 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  38.37 
 
 
184 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  37.79 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  37.21 
 
 
184 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  37.21 
 
 
184 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  35.54 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  34.27 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  32.42 
 
 
181 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  31.61 
 
 
181 aa  104  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  34.29 
 
 
186 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  33.71 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  33.91 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  32.95 
 
 
184 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  34.25 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  35.77 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  43.33 
 
 
144 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  44.14 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  32.32 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  42.61 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  35.06 
 
 
147 aa  88.2  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  39.13 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  33.33 
 
 
145 aa  87.8  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  35.81 
 
 
148 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  39.13 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  40.5 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  40.16 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  39.02 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  40.91 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  38.6 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  38.46 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  35.65 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  36.57 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  34.78 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  35.82 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  38.79 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  40.19 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.84 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  36.75 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  39.77 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  36.84 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  32.84 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  42.53 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  37.5 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  36.46 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  36.08 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  36.08 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  37.78 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  37.78 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  35.56 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  37.11 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  32.73 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  35.45 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  36.08 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  31.53 
 
 
142 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  35.35 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.59 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  27.66 
 
 
151 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  35.05 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  36.46 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  29.2 
 
 
142 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  31.96 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  29.2 
 
 
142 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  29.2 
 
 
142 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  24.78 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  35.96 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.45 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  35.11 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  29.75 
 
 
138 aa  58.9  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  34.04 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  25.81 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  28.44 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  27.59 
 
 
142 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  31.96 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  31.91 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  30.63 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  31.09 
 
 
410 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  28.97 
 
 
137 aa  51.2  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  32.52 
 
 
406 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  30.25 
 
 
410 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  29.73 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  29.51 
 
 
129 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  28.57 
 
 
407 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.33 
 
 
136 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  31.53 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  31.67 
 
 
630 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>