294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1930 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  100 
 
 
407 aa  821    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  82.8 
 
 
406 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  83.54 
 
 
407 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  74.69 
 
 
406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  73.83 
 
 
406 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  74.14 
 
 
409 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  69.29 
 
 
405 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  60.1 
 
 
412 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  57.49 
 
 
408 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  59.8 
 
 
406 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  58.87 
 
 
409 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  56.76 
 
 
410 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  53.98 
 
 
415 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  57.35 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  57.18 
 
 
405 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  49.88 
 
 
413 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  47.77 
 
 
405 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  51.62 
 
 
402 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  50.97 
 
 
410 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  50.49 
 
 
410 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  51.26 
 
 
397 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  50.74 
 
 
418 aa  339  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  51.6 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  51.85 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  47.07 
 
 
411 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  58.85 
 
 
257 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  58.16 
 
 
257 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  54.44 
 
 
251 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  47.47 
 
 
259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  51.39 
 
 
255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  48.44 
 
 
258 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  46.61 
 
 
256 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  47.41 
 
 
256 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  52.67 
 
 
259 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  44.76 
 
 
250 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  43.15 
 
 
250 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  48.26 
 
 
256 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  38.4 
 
 
259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  57.93 
 
 
145 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  57.35 
 
 
153 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  51.52 
 
 
135 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  48.03 
 
 
132 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  47.24 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  46.51 
 
 
132 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  43.61 
 
 
135 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  46.67 
 
 
135 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  44.19 
 
 
130 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  45.76 
 
 
130 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  45.76 
 
 
130 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  45.76 
 
 
130 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  44.19 
 
 
130 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  42.64 
 
 
130 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  40.58 
 
 
129 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  44.92 
 
 
130 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  43.9 
 
 
142 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  40 
 
 
128 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  43.1 
 
 
136 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  39.26 
 
 
127 aa  92.8  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  39.69 
 
 
137 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  38.4 
 
 
137 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  41.86 
 
 
127 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  35.43 
 
 
133 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  38.71 
 
 
129 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  34.78 
 
 
138 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  35.04 
 
 
133 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  38.28 
 
 
131 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  30.04 
 
 
252 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  37.39 
 
 
141 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.07 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  39.09 
 
 
133 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  39.09 
 
 
133 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  39.09 
 
 
133 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  39.09 
 
 
133 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  39.09 
 
 
133 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.19 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  34.43 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  35.65 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  34.43 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  34.43 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  36.36 
 
 
133 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  39.45 
 
 
153 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  39.64 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  31.58 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  33.61 
 
 
133 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  34.53 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  37.29 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.16 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  34.55 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  31.25 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  34.55 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  38.18 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  38.18 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  32.79 
 
 
130 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  30.15 
 
 
134 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  30.15 
 
 
134 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  30.41 
 
 
163 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  34.35 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  29.2 
 
 
134 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  32.52 
 
 
134 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>