106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6453 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  96.7 
 
 		 182 aa  366  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  60.11 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  62.43 
 
 		 184 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  58.89 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  61.4 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  60.82 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  60.82 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  60.23 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  60.23 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  49.16 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  45.2 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  40.8 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  36.21 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  36.26 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  34.27 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  32.95 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  38.51 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  33.89 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  39.66 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  34.43 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  39.55 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  33.12 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  41.59 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  38.14 
 
 		 147 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  32.03 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.61 
 
 		 199 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  33.33 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  36.75 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  31.52 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  34.48 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  34.96 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.88 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  41.07 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  40.38 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  35.77 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  42.34 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  25.77 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  33.95 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.12 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  33.33 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  36.28 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  42.57 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  31.4 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  35.09 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  37.17 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  36.28 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  31.43 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  32.03 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  33.33 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  31.58 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  24.29 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  32.62 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  31.91 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.66 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  32.14 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.44 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.51 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  32.74 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  26.38 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  26.38 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  33.33 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  26.38 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  32.58 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  40.28 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  29.31 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  36.49 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  35.14 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  24.79 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  20.49 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  33.78 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  31.48 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  34.78 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42 
 
 		 127 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  31.25 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  33.33 
 
 		 630 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  29.9 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  31.48 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  32.43 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  32.43 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  32.53 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  40 
 
 		 409 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  30.28 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.226046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  32.91 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  31.08 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  32.43 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  36.23 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1286  OsmC/Ohr family protein  30.23 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0257508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  34.85 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  25 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  32.35 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  28.68 
 
 		 357 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  25.21 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  31.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  29.7 
 
 		 170 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  29.41 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>