154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3413 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  100 
 
 
171 aa  340  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  52.46 
 
 
172 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  42.47 
 
 
177 aa  120  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  41.38 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  39.01 
 
 
145 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  38.41 
 
 
176 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  43.44 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  34.29 
 
 
190 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  36.7 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  38.24 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  34.92 
 
 
147 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  40 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  34.97 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  34.97 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  32.08 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  34.75 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  34.75 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  34.75 
 
 
184 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  38.18 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  34.09 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  38.79 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.57 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  33.77 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  38.26 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.21 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.23 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  35.09 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  33.12 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.09 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  33.85 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  36.84 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  34.21 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  29.33 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  31.54 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  36.63 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.21 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  39.66 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  36.79 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  33.33 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  45 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.11 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  38.79 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  38.79 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  30.95 
 
 
138 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  39.64 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.45 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  40.91 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  35.19 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  29.51 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  44.94 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  33.64 
 
 
168 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  46.34 
 
 
208 aa  60.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.57 
 
 
182 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  35.45 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.36 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  39.06 
 
 
74 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  33.33 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  29.41 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  32.46 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  31.2 
 
 
132 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  30.89 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  35.82 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  33.67 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  25.44 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  25.38 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  24 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  28.07 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  29.46 
 
 
137 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  29.17 
 
 
169 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  34.55 
 
 
135 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  33.68 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  31.97 
 
 
183 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  31.09 
 
 
130 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  31.09 
 
 
130 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  31.09 
 
 
130 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  31.69 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.66 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  27.64 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  26.92 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  30.58 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  31.97 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  30 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  31.48 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  23.81 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  30.19 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  30.25 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  30.19 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  27.68 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  29.75 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  33.04 
 
 
407 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  36.05 
 
 
630 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  28.1 
 
 
200 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  27.7 
 
 
405 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  29.75 
 
 
169 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  29.41 
 
 
130 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  30.25 
 
 
130 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  30.68 
 
 
138 aa  47.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  30.25 
 
 
130 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  29.63 
 
 
408 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>