95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2612 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  100 
 
 
208 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  85.56 
 
 
180 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  73.3 
 
 
190 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  71.52 
 
 
176 aa  242  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  60.59 
 
 
185 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  60 
 
 
185 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  60.95 
 
 
177 aa  214  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  59.41 
 
 
185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  60 
 
 
179 aa  204  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  56.98 
 
 
182 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  63.64 
 
 
159 aa  197  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  39.89 
 
 
183 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  39.34 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  39.34 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  41.04 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  40.68 
 
 
187 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  38.65 
 
 
179 aa  95.5  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  34.97 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  36.67 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  35.71 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  36.97 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  40 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.23 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  40.19 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  32.43 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  37.39 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  37.17 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  36.28 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  34.55 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  36.28 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  30.97 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.7 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  35.65 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  38.05 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  38.05 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  35.65 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  38.05 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  29.58 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  38.05 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  38.05 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  35.96 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  31.62 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.73 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.17 
 
 
145 aa  61.6  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  46.34 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  28.1 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  36.36 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  30.48 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.58 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  29.06 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.97 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  27.5 
 
 
144 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.95 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  34.51 
 
 
170 aa  54.7  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  27.27 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  27.12 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.13 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.06 
 
 
144 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  27.43 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.63 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  29.82 
 
 
151 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  28.81 
 
 
136 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  33.67 
 
 
169 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  32.65 
 
 
169 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  25 
 
 
142 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  31.31 
 
 
169 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.1 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  37.29 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  24.03 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  31.07 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  24.03 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  24.03 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  24.03 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  27.66 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  24.03 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  27.12 
 
 
130 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  26.27 
 
 
127 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  28.97 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  29.76 
 
 
135 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  30.21 
 
 
169 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  23.21 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.27 
 
 
412 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  24.11 
 
 
142 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  41.51 
 
 
411 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  29.17 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  27.97 
 
 
130 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  24.11 
 
 
142 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  29.17 
 
 
169 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  28.26 
 
 
138 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  40 
 
 
134 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  29.55 
 
 
168 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  23.21 
 
 
142 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  32.14 
 
 
163 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  34.33 
 
 
131 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>