52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3007 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  100 
 
 		 146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  68.06 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  67.36 
 
 		 142 aa  209  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  67.36 
 
 		 142 aa  209  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  65.97 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  64.34 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  29.46 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  29.17 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  26.98 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  28.15 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.95 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  33.33 
 
 		 193 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.11 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.1 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  28.97 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  27.78 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.87 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  23.57 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  28.44 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.83 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  30.89 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  27.82 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  22.7 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  30.53 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  26.36 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  25.4 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  28.71 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  28.44 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.33 
 
 		 412 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  20.59 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  25.83 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  26.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  24.43 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  27.59 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.45 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  29.37 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  29.46 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  22.03 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  31.11 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  25 
 
 		 248 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  24.3 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  28.12 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  29.93 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  24.14 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0879  OsmC family protein  28.24 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  27.36 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  23.01 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  25 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  26.27 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  24.78 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  29.76 
 
 		 169 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>