200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2354 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  100 
 
 		 170 aa  333  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  52.94 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  51.3 
 
 		 176 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  47.73 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  47.01 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  50.39 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  46.43 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  52.29 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  41.38 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  37.28 
 
 		 202 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  37.96 
 
 		 144 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  39.66 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  39.66 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.66 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  37.5 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  32.74 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  36.43 
 
 		 184 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  36.43 
 
 		 184 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  38.79 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  38.79 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  38.79 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  40.59 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.64 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  35.77 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  38.6 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  35.37 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  35.83 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  41.24 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  33.33 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  37.1 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  40.16 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  36.42 
 
 		 202 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  39.62 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  36.75 
 
 		 185 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  31.79 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  28 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  34.09 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  35.92 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  29.94 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  29.94 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  29.94 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.33 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  24.71 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  36.75 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.25 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  30.83 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  30.95 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  32.31 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.51 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  36.36 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  33.33 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  32.12 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  28.46 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  35.65 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  28.12 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  26 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  37.01 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  46.77 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  33.91 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  34.65 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  33.62 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  46.55 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  34.78 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  34.78 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  33.91 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  30.08 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  34.82 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  31.3 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  42.37 
 
 		 410 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  31.3 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.58 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  31.37 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  37.18 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  23.57 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  24.26 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  28.57 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  33.33 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  24.26 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  41.94 
 
 		 415 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  24.26 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  33.64 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  30.23 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  31.3 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  32 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  29.29 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  32 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.96 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  27.91 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  49.12 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  31.87 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  32 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  34.51 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  30.58 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  33.63 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  29.7 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>