20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0706 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  25.24 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  23.57 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  28.33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  37.7 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  26.85 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  26.45 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  24.07 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  24.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  24.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  24.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  23.89 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  23.89 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  25.44 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  25.44 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  28.21 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  25.47 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  24.6 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  24.56 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  26.77 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>