87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2794 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  100 
 
 
142 aa  294  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  85.11 
 
 
142 aa  254  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  85.11 
 
 
142 aa  254  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  85.11 
 
 
142 aa  254  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  82.98 
 
 
142 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  64.34 
 
 
146 aa  201  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  31.91 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.65 
 
 
144 aa  84.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.01 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  33.33 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.46 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.08 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  34.23 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  35.04 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.12 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  29.46 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.69 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.53 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.85 
 
 
177 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.1 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  25.93 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  28.69 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.7 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.08 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  26.56 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  29 
 
 
202 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  24.39 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.24 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  30.17 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  30.28 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  24.8 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  26.61 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  27.64 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  29.5 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  26.32 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  27.07 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  31.19 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  26.92 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  31.87 
 
 
206 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  26.92 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  28.57 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  27.73 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  27.73 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  27.73 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.45 
 
 
412 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  25 
 
 
208 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  28.7 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  26.92 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  23.48 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  26.83 
 
 
202 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  26.19 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  25.38 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.82 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  30 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  24.35 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  28.78 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  28.78 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  23.74 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0879  OsmC family protein  24.8 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  25.2 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  26.89 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  24.07 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  28.69 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  31.4 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  28.85 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  23.85 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  24.55 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  26.89 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  26.67 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.24 
 
 
406 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  26.71 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  29.57 
 
 
407 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  23.58 
 
 
151 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  25.84 
 
 
168 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  24.29 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  28 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  23.2 
 
 
406 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  28 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  25.98 
 
 
413 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  27.83 
 
 
407 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  21.43 
 
 
183 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  26.36 
 
 
405 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>