96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4264 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  77.17 
 
 		 184 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  77.17 
 
 		 184 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  77.17 
 
 		 184 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  76.09 
 
 		 184 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  76.09 
 
 		 184 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  74.73 
 
 		 186 aa  284  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  74.19 
 
 		 186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  62.43 
 
 		 182 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  62.43 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  45.3 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  44.07 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  40.94 
 
 		 206 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  32.75 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  34.5 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.89 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  38.61 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  32.95 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  33.33 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  40.59 
 
 		 170 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  31.87 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  32.9 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  40.21 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  40.62 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  34.81 
 
 		 147 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  29.71 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.75 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  30.57 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  32.08 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  32.26 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  32.78 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  31.21 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  36.59 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  40.38 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  36.67 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  32.22 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  28.12 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  37.89 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  30.19 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  30.19 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  29.53 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  29.38 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  28.3 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  32.5 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  37.25 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  26.97 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  25 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  35.65 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  33.88 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  33.33 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  34.02 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  29.41 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  27.45 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  28.32 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.57 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  31.68 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.88 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  26.39 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  25.21 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  29 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  27 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  30.43 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  30.08 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  29 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  32.94 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  27 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  28 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  35.44 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  28.18 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.45 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  29.52 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  41.79 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  29.52 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  29.52 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  29.59 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  29.17 
 
 		 357 aa  45.1  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  28.74 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  25.71 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  25.47 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  28.04 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  26.32 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  40 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  37.04 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  23.21 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  27.16 
 
 		 410 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  27.16 
 
 		 410 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  26.95 
 
 		 162 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1286  OsmC/Ohr family protein  34.07 
 
 		 146 aa  42  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0257508  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.6 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  30.21 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>