172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2557 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  100 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  72.26 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  57.04 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  53.12 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  51.56 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  53.97 
 
 		 248 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  51.16 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  47.45 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  38.64 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  40.34 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  39.05 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  42.45 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  26.12 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  33.08 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  28.68 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  33.08 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  32 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  24.03 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  35.45 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  26.98 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  35.45 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  33.64 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  34.55 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  23.31 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  34.51 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  33.88 
 
 		 407 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  33.64 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  33.64 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  33.64 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  23.7 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  29.17 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  30.6 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  24.22 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  31.93 
 
 		 407 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  38.04 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  23.7 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  26.19 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  25 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  28.57 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  33.33 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  35.29 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  31.97 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  27.91 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  32.14 
 
 		 409 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  23.93 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  25.98 
 
 		 735 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  30.69 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  31.4 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  28.93 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  28.26 
 
 		 415 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  28.57 
 
 		 406 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  32.14 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  27.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.87 
 
 		 408 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  31.75 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  27.88 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  27.03 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  30.51 
 
 		 413 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  34.21 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  30.77 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  27.97 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  30.36 
 
 		 409 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  30.7 
 
 		 734 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  28.46 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  30.7 
 
 		 734 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  28.78 
 
 		 732 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  26.96 
 
 		 731 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  29.46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  28.81 
 
 		 734 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  29.27 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  30.7 
 
 		 734 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  30.51 
 
 		 408 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  26.55 
 
 		 727 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  27.86 
 
 		 734 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  27.82 
 
 		 410 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  27.82 
 
 		 410 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  29.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  29.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  29.91 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  30 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  30.51 
 
 		 408 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  26.98 
 
 		 729 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  26.62 
 
 		 728 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  26.09 
 
 		 728 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  26.98 
 
 		 729 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  30.23 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  26.98 
 
 		 729 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  26.98 
 
 		 729 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  26.09 
 
 		 728 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  28.8 
 
 		 406 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  26.98 
 
 		 728 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  24.77 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  34.04 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>