172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0921 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  100 
 
 
136 aa  277  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  55.04 
 
 
135 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  56.1 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  52.71 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  49.61 
 
 
132 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  49.61 
 
 
132 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  55.05 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  55.05 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  55.05 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  50.39 
 
 
130 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  51.16 
 
 
130 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  50.39 
 
 
130 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  50.39 
 
 
130 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  42.86 
 
 
141 aa  110  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  49.15 
 
 
153 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  42.75 
 
 
415 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  46.55 
 
 
406 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  47.06 
 
 
411 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  44.83 
 
 
406 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  42.15 
 
 
410 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  44.83 
 
 
405 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  44.17 
 
 
135 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  43.33 
 
 
410 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  48.31 
 
 
412 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  41.67 
 
 
402 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  36.97 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  43.48 
 
 
410 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  45.69 
 
 
409 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  40.71 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  41.6 
 
 
407 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  46.79 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  43.1 
 
 
407 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  43.07 
 
 
413 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  39.42 
 
 
423 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  40.17 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  38.66 
 
 
405 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  44.53 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  40 
 
 
406 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  40.37 
 
 
133 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  38.05 
 
 
418 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  45.79 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  45.05 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  50 
 
 
137 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  39.13 
 
 
405 aa  87.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  40 
 
 
409 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  35.56 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  40 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  34.81 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  34.81 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  35.07 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  39.29 
 
 
408 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  34.81 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  34.81 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  34.81 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  34.07 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  35.51 
 
 
397 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  35.07 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  35.07 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  35.07 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  38.39 
 
 
408 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  35.54 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  35.48 
 
 
408 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  37.96 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  34.09 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  34.09 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  33.94 
 
 
406 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  36.63 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  35.45 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  31.85 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  36.63 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  42.86 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  37.96 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  33.88 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  35.64 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  33.06 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02028  hypothetical protein  49.33 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.326334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  33.98 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  33.33 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  34.95 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  28.12 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.33 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  31.73 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  30.63 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  30.69 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  31.62 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  34.31 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  25.21 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  27.83 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  30.69 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  32.76 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  26.85 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  26.85 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  30.91 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  40.74 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  27.27 
 
 
193 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  38.89 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>