87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1143 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  100 
 
 		 142 aa  295  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  99.3 
 
 		 142 aa  293  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  99.3 
 
 		 142 aa  293  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  95.07 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  85.11 
 
 		 142 aa  254  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  68.06 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  31.91 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  30.16 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.78 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  27.27 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  34.26 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.75 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.84 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  35.29 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  28.68 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  29.2 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  29.6 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.75 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  31.67 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.36 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  30.61 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  24.26 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  24.6 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.11 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.56 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  26.77 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  25.78 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  28.68 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  29.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  27 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  29.91 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  29.91 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  29.91 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  25.42 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  29.36 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.97 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  27.56 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  23.2 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.97 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  27.56 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  28.44 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  22.61 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  25.2 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  23.77 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  24.39 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  27.64 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  26.92 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0706  redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.27 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000956908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  29.09 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  25.23 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  26.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  22.66 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  24.06 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  25.45 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  25.89 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  23.21 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  25.21 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  23.42 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  22.66 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  24.24 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  25.93 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  23.39 
 
 		 172 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  24.82 
 
 		 406 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  24.32 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.2 
 
 		 132 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  27.45 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  24.62 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0879  OsmC family protein  25.81 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  26.62 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  24.78 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  24.24 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  29.09 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  25 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  26.23 
 
 		 423 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  27.1 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  24.17 
 
 		 415 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  26.4 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  24.82 
 
 		 406 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  26.17 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  23.36 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  26.5 
 
 		 407 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  28.89 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  24.63 
 
 		 181 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  22.32 
 
 		 180 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>