154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0361 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  100 
 
 
140 aa  277  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  75 
 
 
138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  55.12 
 
 
163 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  53.08 
 
 
151 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  51.56 
 
 
133 aa  133  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  53.12 
 
 
248 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  50.78 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  44.96 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  40 
 
 
134 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  39.81 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  38.89 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  30.47 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  28.91 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  28.91 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  26.56 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  32.33 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  26.98 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  35.4 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  24.81 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  29.71 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  25.19 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  25.19 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  29.32 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  31.82 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  31.82 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  31.82 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  27.13 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  33.98 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  29.32 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  24.22 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  31.82 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  36.96 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  26.61 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  30.91 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  29.08 
 
 
407 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  30.91 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  30.91 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  29.17 
 
 
423 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  33.33 
 
 
418 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  28.07 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  28.8 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  29.55 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  27.07 
 
 
407 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  28.7 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  28.12 
 
 
406 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  27.82 
 
 
406 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  29.81 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  29.27 
 
 
409 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  25.62 
 
 
727 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  31.13 
 
 
410 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  29.09 
 
 
409 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  26.4 
 
 
728 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  26.36 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.85 
 
 
406 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.41 
 
 
412 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  27.2 
 
 
735 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  26.83 
 
 
732 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  31.25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  29 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  25.21 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  27.27 
 
 
734 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  28.18 
 
 
415 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  34.57 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  26.4 
 
 
728 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  25 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.03 
 
 
408 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  31.82 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  24.8 
 
 
728 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  25.6 
 
 
729 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  26.4 
 
 
728 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  25.6 
 
 
729 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  25.6 
 
 
728 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  25.6 
 
 
729 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  26.53 
 
 
734 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  25.6 
 
 
729 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  30 
 
 
137 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  26.45 
 
 
734 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  28.68 
 
 
142 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  25.62 
 
 
731 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  25.4 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  25.6 
 
 
742 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  25.6 
 
 
742 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  25.6 
 
 
742 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  26.45 
 
 
734 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  28.68 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  28.68 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  23.2 
 
 
728 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  25.6 
 
 
728 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  24.55 
 
 
402 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  25.35 
 
 
406 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.92 
 
 
170 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  26.32 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  25.62 
 
 
734 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  27.86 
 
 
408 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  22.22 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  26.67 
 
 
413 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  25.44 
 
 
405 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  26.26 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  24.8 
 
 
728 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  24.8 
 
 
728 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>