42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1605 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  43.31 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  38.89 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  38.71 
 
 
163 aa  89  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  41.03 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  39.1 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  36.67 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  35.43 
 
 
133 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  34.65 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  34.65 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  34.35 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  29.32 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  32.82 
 
 
135 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  31.97 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  31.65 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  36.28 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  23.31 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  36 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  29.41 
 
 
159 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  27.27 
 
 
135 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  36 
 
 
132 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  25.35 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  32.98 
 
 
127 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  32.05 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  25.21 
 
 
127 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  36.23 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  30.19 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  25.95 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.27 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  23.7 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  29.75 
 
 
130 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  34.38 
 
 
407 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  37.25 
 
 
407 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  40.43 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.68 
 
 
412 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  32.91 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  32.91 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  32.91 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  32.91 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  32.91 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  32.91 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  32.91 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>