127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2325 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  39.08 
 
 
202 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  38.51 
 
 
182 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  38.61 
 
 
184 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  37.27 
 
 
182 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  34.66 
 
 
202 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  36.67 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  36.67 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  37.25 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  37.25 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  33.91 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  37.91 
 
 
177 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  36.36 
 
 
199 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  36 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  34.76 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  32.76 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  32.16 
 
 
190 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.73 
 
 
147 aa  97.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  36.08 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  32.02 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  36.57 
 
 
148 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  30.82 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  40.14 
 
 
145 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.87 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  34.81 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  32.95 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  31.67 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  40.16 
 
 
170 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  37.5 
 
 
147 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  33.99 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  30.06 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  35.51 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  28.66 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  34.73 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  36.36 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.04 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  33.87 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  35.07 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  27.47 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  34.75 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  25.79 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  30.77 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  24.14 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  38.28 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  36.09 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  35.12 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  30.97 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  31.82 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  30 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  28.21 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  37.82 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.45 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.85 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  32.28 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  31.85 
 
 
159 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  34.43 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  33.61 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29.24 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  28.3 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  30.57 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  57.8  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  33.67 
 
 
129 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  27.27 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  30.57 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  30.57 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  26.15 
 
 
134 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  27.75 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  29.11 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  29.25 
 
 
138 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  31.63 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  29.87 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.83 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  32.71 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  29.19 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  31.25 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  29.19 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  28.21 
 
 
129 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  32.95 
 
 
405 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  29.01 
 
 
131 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28.57 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  37.7 
 
 
127 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  32 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  30.93 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  35.33 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  26.92 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  34.13 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  34.65 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  34.48 
 
 
135 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  35.79 
 
 
141 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  33.62 
 
 
135 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  34.38 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  35.59 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  26.92 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  35.59 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  28.21 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  35.59 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  26.92 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  33.77 
 
 
410 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>