124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2142 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  100 
 
 
129 aa  266  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  46.53 
 
 
129 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  44.14 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  42.34 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  42.34 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  42.34 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  44.14 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  44.14 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  44.14 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  44.14 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  44.14 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  40.34 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  43.24 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  42.34 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42.52 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  44.14 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  44.14 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  44.8 
 
 
127 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  40.91 
 
 
133 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  40.54 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  40.8 
 
 
409 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  41.28 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  39.64 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  38.71 
 
 
407 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  38.93 
 
 
408 aa  84.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  41.8 
 
 
415 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  37.69 
 
 
406 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  35.61 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  38.1 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  36.72 
 
 
407 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  39.06 
 
 
406 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  37.4 
 
 
405 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  40.15 
 
 
412 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  36.29 
 
 
406 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  36.22 
 
 
405 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  40.48 
 
 
402 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  38.46 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  39.09 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  33.86 
 
 
410 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  35.43 
 
 
409 aa  77  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  42.31 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  38.58 
 
 
411 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  36.59 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  42.31 
 
 
130 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  42.31 
 
 
130 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  41.35 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  37.59 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  36.44 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  41.35 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  33.58 
 
 
406 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  38.94 
 
 
418 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  39.05 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  39.05 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  37.21 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  34.09 
 
 
410 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  33.88 
 
 
408 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  34.09 
 
 
410 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  33.88 
 
 
408 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  32.81 
 
 
423 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  31.85 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  33.91 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  29.01 
 
 
405 aa  68.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  34.71 
 
 
397 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.58 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  30.91 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  34.95 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  35.58 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  40.19 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  27.05 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  37.84 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  45.16 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  31.63 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  26.27 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  24.59 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.56 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  44.26 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.33 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  27.87 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.83 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  29.06 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  28.87 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  30.08 
 
 
202 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  29.27 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  47.27 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  34.75 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  29.27 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  39.68 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  27.12 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  27.12 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.67 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  25.21 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.21 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  27.59 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  26.61 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.8 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  37.25 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  33.33 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  26.23 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>