52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6577 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  91.95 
 
 		 188 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  59.2 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  37.64 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  37.43 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.94 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.67 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.33 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  30.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  27.54 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.88 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.55 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.77 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  26.99 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  26.38 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  26.32 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.41 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  25.17 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  26.24 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  30.43 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  29.52 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  27.34 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  30.49 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  29.13 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  29.41 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  25.93 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  28.12 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  25.93 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  25.93 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  28.81 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  29.66 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  27.56 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  29.06 
 
 		 133 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  32.2 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  35.59 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  32.2 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  32.2 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  34 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  26.92 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  26.92 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  26.24 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  33.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  27.27 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  24.14 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  27.59 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  25.55 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  27.73 
 
 		 187 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  24.77 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  26.13 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  27.62 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>