52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2031 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  100 
 
 
138 aa  278  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  54.81 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  35.46 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.08 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  29.75 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  27.07 
 
 
202 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.57 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  31.48 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  28.57 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  36.71 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  36.71 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  29.52 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  36.71 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  36.71 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  36.71 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  27.34 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  29.13 
 
 
144 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  29.25 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  28 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  25.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  29.91 
 
 
199 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  24.74 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.47 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  29.09 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  35.44 
 
 
184 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  28.18 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  28.04 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  30.68 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  28.04 
 
 
193 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  25.25 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  34.18 
 
 
186 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  28.44 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  24.53 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  26.13 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  25.93 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  27.03 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  27.52 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  32.91 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  32.91 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  25.44 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  28.04 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  25.66 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  25.66 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  28.26 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  28.57 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  26.85 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  27.61 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  29.92 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  24.78 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.18 
 
 
306 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  25.69 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  29.63 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>