49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1072 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  100 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  41.35 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  34.68 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  36.79 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  30.88 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  35.66 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  37.01 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  26.87 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  36.96 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.79 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  28.91 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.43 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  32.2 
 
 		 406 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  24.79 
 
 		 181 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  28 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  34.29 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  33.33 
 
 		 357 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  31.13 
 
 		 406 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  31.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  36.26 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  25.24 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  33.96 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  28.43 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  30.93 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  32.38 
 
 		 412 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  28.1 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  29.52 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  21.5 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  34.92 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  31.31 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  28.72 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  31.31 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  28.68 
 
 		 415 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  31.31 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  29.09 
 
 		 406 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  27.52 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  24.81 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  36.36 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  23.81 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  27 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  32 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  33.67 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  27.18 
 
 		 402 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  28.57 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  40 
 
 		 193 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  27.78 
 
 		 129 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>