222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1457 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  100 
 
 		 144 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3872  organic hydroperoxide resistance protein OhrB, OsmC family  29.2 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  30.22 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  33.01 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.83 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  31.15 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2063  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  25.49 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0455  OsmC family protein  32.41 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.48 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  29.06 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2938  OsmC family protein  26.45 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4927  OsmC family protein  26.5 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2001  hypothetical protein  26.8 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650106  normal  0.0215545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  30.34 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7165  OsmC family protein  23.74 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4740  OsmC-like protein  26.62 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  32.69 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2753  OsmC family protein  25.81 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0809  OsmC family protein  25.64 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.06 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5482  OsmC family protein  25.64 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  25.42 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  28.28 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1124  OsmC family protein  27.88 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  29.91 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0428  hypothetical protein  21.24 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3057  OsmC family protein  28.37 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  29.46 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1958  OsmC-like protein  24.67 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000431204  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2165  OsmC family protein  24.34 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000769613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  25.69 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3499  OsmC family protein  27.66 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3622  OsmC family protein  27.66 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.867259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  26.62 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  25.64 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  25.64 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  25.64 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3427  OsmC family protein  27.66 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  25.62 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3312  OsmC family protein  26.95 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0814  OsmC family protein  26.95 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492477 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1812  OsmC family protein  26.27 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.251866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2718  OsmC family protein  28.7 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  28.03 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1777  OsmC family protein  26.27 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0283625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3039  OsmC family protein  24.68 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  25.64 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1298  OsmC family protein  26.55 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3209  OsmC family protein  26.95 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1286  OsmC/Ohr family protein  27.12 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0257508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8688  OsmC family protein  24.79 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2314  OsmC family protein  26.24 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1310  OsmC family protein  23.97 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4270  OsmC family protein  27.1 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0548  OsmC family protein  25.53 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474457  normal  0.130238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1351  OsmC family protein  32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0147839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4479  OsmC-like protein  32.67 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1081  OsmC family protein  28.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.192892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4637  OsmC family protein  26.47 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2509  OsmC family protein  32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122372  normal  0.0137293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  26.92 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04764  redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.64 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  22.88 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  28.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1236  OsmC family protein  26.61 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  27.13 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5213  OsmC-like protein  26.28 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832752  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001046  organic hydroperoxide resistance protein  24.79 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5646  OsmC family protein  26.28 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0186401  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  25.89 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  26.67 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1948  OsmC family protein  27.67 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  27.27 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0865  OsmC family protein  26.95 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3330  organic hydroperoxide resistance protein  24.79 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0334  OsmC family protein  30.37 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  27.91 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2414  OsmC family protein  25.23 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  25.52 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4583  OsmC family protein  27.85 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000769808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2862  OsmC family protein  23.48 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.685422  normal  0.837352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2114  OsmC family protein  25.66 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0029587  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0231  putative organic hydroperoxide resistance protein  25.35 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  27.21 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  26.92 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  26.39 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4785  OsmC family protein  26.47 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  24.29 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  26.89 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  27.4 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4367  OsmC family protein  25.93 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0713  redox protein  26.5 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  27.08 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  25 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  24.17 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  28.69 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>