177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1286 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1286  OsmC/Ohr family protein  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0257508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1777  OsmC family protein  65.73 
 
 
148 aa  199  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0283625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1812  OsmC family protein  65.73 
 
 
148 aa  199  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.251866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0428  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0809  OsmC family protein  35.86 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  26.28 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  30.09 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  27.86 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  30.32 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  31.43 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  27.45 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  24.14 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8688  OsmC family protein  28.1 
 
 
137 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  25.9 
 
 
139 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  25.9 
 
 
139 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0432  OsmC-like protein  27.94 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  25 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  25 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  24.81 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001046  organic hydroperoxide resistance protein  25 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  25.9 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  27.12 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  26.92 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  26.92 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  24.46 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  26.92 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  26.06 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  25.18 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  25.18 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  25.18 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  25.18 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  25.18 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  29.91 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  30.53 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  24.49 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.53 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04764  redox protein, regulator of disulfide bond formation  24.31 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2263  OsmC-like protein  26.81 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  22.14 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  25.35 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  25.71 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  26.43 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  21.01 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37030  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.15 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0241406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  24.46 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1165  OsmC family protein  24.51 
 
 
150 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0338  OsmC family protein  24.48 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  26.92 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  26.03 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  24.66 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  23.02 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  26.15 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  20.14 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  22.3 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  25.68 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  24.65 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  23.97 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  26.15 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2167  OsmC family protein  25 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335018  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  27.62 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  29.08 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  22.7 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  31.4 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  25.71 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  21.58 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  25.71 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  22.88 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  23.02 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1675  OsmC family protein  27.82 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110277  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  25.71 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06163  hypothetical protein  24.51 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  25 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  24.46 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  25.9 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  22.7 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  27.36 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  24.04 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  24.04 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  24.04 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  24.65 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  27 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  27.82 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  23.18 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  24.24 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  21.05 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3591  OsmC-like protein  30.91 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.572762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  24.04 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0530  OsmC-like protein  23.44 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  30.23 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  24.04 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  23.3 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  24.04 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  25 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  23.02 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  22.86 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  25.24 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1702  OsmC family protein  27.07 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0924  OsmC family protein  28 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  25.24 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  21.43 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>