More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2752 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  72.79 
 
 
140 aa  203  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  72.79 
 
 
140 aa  203  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  72.79 
 
 
140 aa  203  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  67.38 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  67.86 
 
 
140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  67.63 
 
 
139 aa  194  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  69.93 
 
 
142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  65 
 
 
140 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  59.29 
 
 
142 aa  169  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  58.09 
 
 
143 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  60.58 
 
 
140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  54.41 
 
 
143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  58.16 
 
 
147 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.88 
 
 
142 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 
138 aa  150  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  54.35 
 
 
138 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  53.62 
 
 
138 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04764  redox protein, regulator of disulfide bond formation  57.78 
 
 
140 aa  147  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2314  OsmC family protein  54.89 
 
 
140 aa  148  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  57.89 
 
 
140 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000950914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  51.82 
 
 
142 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  51.82 
 
 
142 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  51.82 
 
 
142 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  55.88 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001046  organic hydroperoxide resistance protein  56.39 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0338  OsmC family protein  52.52 
 
 
144 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3790  peroxiredoxin, Ohr subfamily  52.9 
 
 
145 aa  143  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3872  organic hydroperoxide resistance protein OhrB, OsmC family  56.15 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  53.57 
 
 
139 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  56.52 
 
 
141 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  50.36 
 
 
190 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  53.96 
 
 
140 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0231  putative organic hydroperoxide resistance protein  55.64 
 
 
145 aa  140  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  55.32 
 
 
140 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  52.14 
 
 
143 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  53.62 
 
 
142 aa  140  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  47.83 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  52.86 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  53.79 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  53.24 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  52.14 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  54.81 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  52.82 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0976  organic hydroperoxide resistance protein  55.64 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  51.43 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  51.43 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  55.71 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  51.82 
 
 
140 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  51.82 
 
 
140 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  52.48 
 
 
140 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  48.51 
 
 
141 aa  135  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  51.43 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  51.43 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  51.8 
 
 
139 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  51.43 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  51.8 
 
 
139 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  52.9 
 
 
142 aa  135  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1516  OsmC family protein  52.63 
 
 
140 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  hitchhiker  0.00144478 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  50.71 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8688  OsmC family protein  49.26 
 
 
137 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  51.8 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  50.71 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  51.8 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  51.8 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3057  OsmC family protein  56.45 
 
 
141 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3330  organic hydroperoxide resistance protein  55.28 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1386  OsmC family protein  54.14 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234237  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  48.94 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  52.48 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3209  OsmC family protein  57.26 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  51.8 
 
 
139 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  49.64 
 
 
139 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  53.66 
 
 
139 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5175  OsmC family protein  63.92 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  51.06 
 
 
140 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  49.64 
 
 
140 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3312  OsmC family protein  56.45 
 
 
141 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  52.21 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  52.55 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0814  OsmC family protein  57.26 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000492477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  50.72 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  52.86 
 
 
141 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  53.19 
 
 
140 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  54.68 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  52.48 
 
 
140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  52.17 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3427  OsmC family protein  55.65 
 
 
141 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3622  OsmC family protein  55.65 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.867259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3499  OsmC family protein  55.65 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  51.85 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  57.35 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>