More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0446 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  100 
 
 
146 aa  296  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  57.86 
 
 
140 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  55.71 
 
 
142 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  55.71 
 
 
142 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  57.14 
 
 
140 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  55.71 
 
 
142 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  56.43 
 
 
140 aa  157  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  55.71 
 
 
142 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  58.27 
 
 
139 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  55 
 
 
140 aa  154  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  60.43 
 
 
139 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  57.55 
 
 
139 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  57.04 
 
 
141 aa  151  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  56.03 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  58.99 
 
 
139 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  58.99 
 
 
139 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  58.99 
 
 
139 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  58.99 
 
 
139 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  58.99 
 
 
139 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  55.47 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  54.29 
 
 
141 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  56.52 
 
 
139 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  58.27 
 
 
139 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  58.27 
 
 
139 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  56.03 
 
 
142 aa  146  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  52.86 
 
 
141 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  55.07 
 
 
139 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  55.07 
 
 
139 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  58.16 
 
 
142 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  55.07 
 
 
139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  51.08 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  53.57 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  55.47 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  52.86 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  54.35 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  54.35 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  54.35 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  56.52 
 
 
139 aa  144  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  52.14 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  52.14 
 
 
141 aa  143  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  54.74 
 
 
139 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  54.29 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  52.59 
 
 
142 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  58.39 
 
 
140 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  51.43 
 
 
141 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  51.43 
 
 
141 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  50.71 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  54.07 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  55.56 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  52.14 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  52.63 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3323  OsmC family protein  56.2 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800785  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  56.83 
 
 
140 aa  137  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  50.71 
 
 
141 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  53.73 
 
 
141 aa  137  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  50 
 
 
140 aa  138  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  56.83 
 
 
140 aa  137  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  50.35 
 
 
142 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  53.57 
 
 
143 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  56.83 
 
 
140 aa  137  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  56.43 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  50.35 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  51.43 
 
 
141 aa  137  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  49.29 
 
 
140 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  49.29 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  49.29 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  48.15 
 
 
142 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  55.32 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  55.15 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  55.15 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  47.1 
 
 
141 aa  134  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3872  organic hydroperoxide resistance protein OhrB, OsmC family  57.25 
 
 
136 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  57.35 
 
 
141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  49.29 
 
 
141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  47.86 
 
 
142 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  48.23 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  52.55 
 
 
141 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2305  organic hydroperoxide resistance protein  57.45 
 
 
142 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  50 
 
 
142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  52.11 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  50 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  54.48 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5733  OsmC family protein  50.37 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.930531  normal  0.319768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  49.29 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  51.45 
 
 
137 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6486  OsmC family protein  50.37 
 
 
138 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.19 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  51.41 
 
 
138 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  50.75 
 
 
141 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  51.41 
 
 
138 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  54.48 
 
 
141 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  51.8 
 
 
139 aa  130  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>