More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0028 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  73.94 
 
 		 142 aa  219  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3323  OsmC family protein  61.15 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800785  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0334  OsmC family protein  50.71 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  52.55 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  55.38 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2792  OsmC family protein  52.86 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000166944  hitchhiker  0.0000110677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  54.41 
 
 		 141 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  54.01 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  50.36 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  50.36 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  50.36 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  47.1 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  52.63 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  45.59 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  50.38 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  48.23 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  45.65 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  45.65 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  46.38 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  47.79 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  48.94 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  44.93 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  44.93 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  44.93 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  46.32 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  48.85 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  51.91 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  51.91 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  51.15 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  47.89 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  48.09 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  50 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  47.14 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  47.14 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  51.54 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  50 
 
 		 141 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  47.83 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  50.36 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  47.37 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  48.09 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3872  organic hydroperoxide resistance protein OhrB, OsmC family  49.64 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  48.12 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  48.09 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  48.92 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  45.65 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  46.43 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  45.99 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  47.06 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  45.71 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  45.99 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  47.79 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  47.45 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  46.43 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  44.37 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  43.07 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  45.65 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  43.07 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  47.73 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  43.07 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  43.07 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  46.43 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  46.43 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  43.07 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  49.23 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  43.07 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  43.07 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  51.15 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  49.62 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  48.44 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  49.6 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  42.34 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  48.44 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  43.57 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  49.23 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  44.29 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  48.03 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2265  organic hydroperoxide resistance protein, putative  45.11 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  45 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  44.53 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8688  OsmC family protein  42.96 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  43.18 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  43.57 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  50.71 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  47.06 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0833  peroxiredoxin, Ohr subfamily  44.36 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  46.92 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  45 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  48.06 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  47.29 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  45.31 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  48.06 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>