252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2263 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2263  OsmC-like protein  100 
 
 
138 aa  289  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5720  OsmC-like protein  68.84 
 
 
138 aa  209  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2464  OsmC-like protein  58.7 
 
 
139 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7220  OsmC family protein  58.39 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  57.25 
 
 
139 aa  167  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1223  OsmC-like protein  57.25 
 
 
139 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1702  OsmC family protein  57.25 
 
 
139 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5124  OsmC-like protein  56.2 
 
 
138 aa  166  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1675  OsmC family protein  56.52 
 
 
139 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110277  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1612  OsmC family protein  55.8 
 
 
139 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1635  OsmC family protein  55.8 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4428  OsmC family protein  57.97 
 
 
139 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.49073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1543  OsmC family protein  56.72 
 
 
139 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.199318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2273  OsmC family protein  55.47 
 
 
138 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0726471  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2206  OsmC-like protein  59.42 
 
 
150 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  52.99 
 
 
149 aa  157  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2049  OsmC family protein  53.28 
 
 
138 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296656  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5565  OsmC family protein  52.24 
 
 
135 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6486  OsmC family protein  55.3 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5733  OsmC family protein  55.3 
 
 
138 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.930531  normal  0.319768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  51.09 
 
 
138 aa  151  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  48.91 
 
 
138 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  48.91 
 
 
138 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  47.45 
 
 
142 aa  139  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  52.55 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0080  OsmC-like protein  53.38 
 
 
138 aa  136  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  45 
 
 
140 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4004  OsmC family protein  50.76 
 
 
136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.911432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5701  OsmC-like protein  51.11 
 
 
138 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549283  normal  0.786939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  45 
 
 
140 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  48.91 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  45.39 
 
 
142 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  47.14 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  46.43 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  43.38 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  46.43 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2460  OsmC family protein  49.62 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  44.2 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  45.39 
 
 
141 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  44.68 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  45.39 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  45.39 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  46.1 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  46.1 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  44.29 
 
 
141 aa  124  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  44.68 
 
 
141 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  46.76 
 
 
140 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  45.39 
 
 
141 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  42.96 
 
 
142 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  43.57 
 
 
141 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  40.58 
 
 
141 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  44.53 
 
 
141 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  42.86 
 
 
141 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  42.86 
 
 
142 aa  119  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  46.27 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  42.86 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  46.1 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4038  OsmC family protein  44.7 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  47.1 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  44.44 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  47.1 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  44.93 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  47.1 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  47.79 
 
 
139 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  45.19 
 
 
139 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  45.19 
 
 
139 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  46.1 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  45.99 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  45.19 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  45.39 
 
 
141 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  44.03 
 
 
142 aa  117  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  43.7 
 
 
142 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  45.39 
 
 
141 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  45.39 
 
 
141 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  44.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  47.06 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  43.28 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  44.53 
 
 
141 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  44.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  44.44 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  44.44 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  45.19 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  46.43 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  44.44 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  44.44 
 
 
139 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  42.96 
 
 
142 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2177  OsmC family protein  45.52 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109988  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  46.1 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.96 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  43.97 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  45.19 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  43.66 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  42.22 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  46.32 
 
 
142 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 
140 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3790  peroxiredoxin, Ohr subfamily  46.76 
 
 
145 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  45.99 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  42.65 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  46.27 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>