298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4428 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4428  OsmC family protein  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.49073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  82.61 
 
 		 139 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1223  OsmC-like protein  81.16 
 
 		 139 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1702  OsmC family protein  81.16 
 
 		 139 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1675  OsmC family protein  80.43 
 
 		 139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1612  OsmC family protein  79.14 
 
 		 139 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1635  OsmC family protein  79.14 
 
 		 139 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1543  OsmC family protein  77.7 
 
 		 139 aa  225  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.199318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5124  OsmC-like protein  77.7 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2464  OsmC-like protein  72.66 
 
 		 139 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7220  OsmC family protein  70.5 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2049  OsmC family protein  71.94 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5733  OsmC family protein  71.32 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.930531  normal  0.319768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6486  OsmC family protein  71.32 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2273  OsmC family protein  72.79 
 
 		 138 aa  196  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0726471  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2206  OsmC-like protein  73.38 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0080  OsmC-like protein  70.5 
 
 		 138 aa  194  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  65.94 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  66.91 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  63.04 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  63.04 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4004  OsmC family protein  65.67 
 
 		 136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.911432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  66.19 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5701  OsmC-like protein  64.71 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549283  normal  0.786939 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5565  OsmC family protein  58.82 
 
 		 135 aa  170  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2263  OsmC-like protein  57.97 
 
 		 138 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  56.03 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  55.4 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  54.29 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  54.29 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6633  OsmC family protein  52.35 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000074416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2460  OsmC family protein  58.52 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4141  OsmC family protein  55.1 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  55.47 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  52.86 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  51.43 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  50.7 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  50 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  51.05 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  53.57 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  52.86 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  52.14 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  51.43 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4038  OsmC family protein  53.73 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  53.91 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  51.43 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  51.41 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  53.91 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  52.14 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  52.55 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  51.43 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  50.71 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  53.57 
 
 		 141 aa  141  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  50.71 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  52.27 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  52.86 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  52.55 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  48.25 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  52.86 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  52.86 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5720  OsmC-like protein  50 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  49.64 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  52.34 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  52.14 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  47.14 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  48.57 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  52.86 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2177  OsmC family protein  54.81 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109988  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  53.33 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  50 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  51.56 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  52.59 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  51.08 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  52.9 
 
 		 141 aa  136  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  53.62 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  52.14 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  51.43 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  53.62 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  48.91 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  55.47 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  52.17 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  52.9 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  51.8 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  51.8 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  51.08 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  50.35 
 
 		 142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  51.08 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  51.08 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  51.08 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  56.69 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  51.08 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  50 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  54.33 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  54.33 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1196  organic hydroperoxide resistance protein  50.35 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1104  OsmC family protein  50.35 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  53.54 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  53.54 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  53.54 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  50.36 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>