99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06163 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06163  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  326  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000353  predicted redox protein  83.44 
 
 
154 aa  275  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2063  hypothetical protein  70.78 
 
 
155 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1921  OsmC family protein  64.29 
 
 
155 aa  218  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0276475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0411  OsmC family protein  57.05 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1731  OsmC family protein  59.73 
 
 
155 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.372414  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2693  OsmC family protein  55.19 
 
 
164 aa  186  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393695  normal  0.105076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4479  OsmC-like protein  57.89 
 
 
156 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2559  OsmC family protein  58.55 
 
 
158 aa  184  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0740791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1435  hypothetical protein  53.29 
 
 
161 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0475  hypothetical protein  53.29 
 
 
161 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1915  OsmC family protein  59.73 
 
 
155 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10754  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0173  hypothetical protein  53.29 
 
 
161 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0907  hypothetical protein  53.29 
 
 
161 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0383  OsmC-like protein  53.29 
 
 
161 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1846  hypothetical protein  53.29 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3388  OsmC-like protein  57.24 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1006  OsmC/Ohr family protein  52.63 
 
 
161 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1336  OsmC family protein  55.19 
 
 
157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1936  OsmC/Ohr family protein  52.63 
 
 
161 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2253  OsmC family protein  55.92 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0722001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0450  OsmC family protein  57.24 
 
 
153 aa  174  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1593  OsmC family protein  53.29 
 
 
159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2509  OsmC family protein  55.33 
 
 
157 aa  164  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122372  normal  0.0137293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1351  OsmC family protein  55.33 
 
 
157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0147839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3515  OsmC family protein  51.97 
 
 
160 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2199  OsmC family protein  51.68 
 
 
157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0026  OsmC family protein  48.7 
 
 
154 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3314  OsmC family protein  54.61 
 
 
159 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  48.68 
 
 
151 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1165  OsmC family protein  47.33 
 
 
150 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4637  OsmC family protein  46.31 
 
 
150 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4270  OsmC family protein  46.31 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4785  OsmC family protein  46.31 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1234  OsmC family protein  42.25 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.353778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1278  OsmC family protein  42.25 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3079  OsmC family protein  42.25 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.448993  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1311  OsmC family protein  41.55 
 
 
145 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3409  OsmC/Ohr family protein  42.96 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2718  OsmC family protein  40.94 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1146  OsmC family protein  42.25 
 
 
145 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240293  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1216  OsmC family protein  42.25 
 
 
145 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1145  OsmC family protein  42.25 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366045  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1081  OsmC family protein  41.55 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.192892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2730  OsmC family protein  40.14 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1225  OsmC-like protein  42.64 
 
 
145 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1236  OsmC family protein  38.57 
 
 
172 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208617  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3312  OsmC family protein  39.72 
 
 
146 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2414  OsmC family protein  41.84 
 
 
145 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1219  OsmC family protein  36.99 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.42 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0523786  normal  0.777865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  32.21 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0907  OsmC family protein  32.45 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.055937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7165  OsmC family protein  31.29 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2165  OsmC family protein  31.72 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000769613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4740  OsmC-like protein  29.61 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2177  OsmC family protein  31.45 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  36 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2411  OsmC family protein  29.8 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1948  OsmC family protein  31.58 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14522  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1947  hypothetical protein  31.54 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1958  OsmC-like protein  29.61 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000431204  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  36.79 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0548  OsmC family protein  38.64 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474457  normal  0.130238 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  35.42 
 
 
357 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2001  hypothetical protein  30.52 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650106  normal  0.0215545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1310  OsmC family protein  29.03 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1692  OsmC family protein  30.87 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0455  OsmC family protein  34.09 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140043  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  28.1 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  28.76 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2114  OsmC family protein  32.26 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0029587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4927  OsmC family protein  28.76 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0713  redox protein  35.42 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5482  OsmC family protein  28.1 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2753  OsmC family protein  34.04 
 
 
200 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2938  OsmC family protein  34.04 
 
 
228 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895882  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1543  OsmC family protein  30.77 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2862  OsmC family protein  29.58 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.685422  normal  0.837352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1124  OsmC family protein  28.57 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3039  OsmC family protein  35.16 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557785  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4583  OsmC family protein  29.41 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000769808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5213  OsmC-like protein  29.41 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5646  OsmC family protein  29.41 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0186401  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4367  OsmC family protein  32.22 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3983  OsmC family protein  33.33 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31351  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1812  OsmC family protein  27.36 
 
 
148 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.251866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1777  OsmC family protein  27.36 
 
 
148 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0283625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1286  OsmC/Ohr family protein  24.51 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0257508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  29.47 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0555  OsmC-like protein  29.09 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000799335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0701  hypothetical protein  29.09 
 
 
125 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0556  OsmC-like protein  29.09 
 
 
125 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0644  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000573251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0611  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000492756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1268  OsmC-like protein protein  31.07 
 
 
132 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0680  hypothetical protein  31.31 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0712  hypothetical protein  30.3 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000905109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4658  hypothetical protein  30.3 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  hitchhiker  7.91751e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>