135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1172 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  100 
 
 		 149 aa  315  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1081  OsmC family protein  44.68 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.192892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1146  OsmC family protein  43.36 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1145  OsmC family protein  43.36 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1234  OsmC family protein  42.55 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.353778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1278  OsmC family protein  42.55 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3079  OsmC family protein  42.55 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.448993  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1216  OsmC family protein  42.66 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2730  OsmC family protein  43.66 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1225  OsmC-like protein  47.41 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1311  OsmC family protein  41.84 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3409  OsmC/Ohr family protein  40.56 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2414  OsmC family protein  41.26 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3312  OsmC family protein  41.73 
 
 		 146 aa  121  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1219  OsmC family protein  40.88 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1236  OsmC family protein  42.97 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1165  OsmC family protein  37.33 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3388  OsmC-like protein  36.43 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2718  OsmC family protein  35.62 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1593  OsmC family protein  35 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2509  OsmC family protein  33.78 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122372  normal  0.0137293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4270  OsmC family protein  34 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1351  OsmC family protein  33.11 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0147839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4785  OsmC family protein  35.1 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4637  OsmC family protein  34 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2693  OsmC family protein  30.92 
 
 		 164 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393695  normal  0.105076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4479  OsmC-like protein  32.21 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0450  OsmC family protein  30.46 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2063  hypothetical protein  32.03 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0907  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0383  OsmC-like protein  31.13 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1915  OsmC family protein  33.11 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0475  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0173  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1435  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2559  OsmC family protein  31.54 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0740791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0026  OsmC family protein  32.89 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1846  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1921  OsmC family protein  30.07 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0276475 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1936  OsmC/Ohr family protein  30.26 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1006  OsmC/Ohr family protein  30.46 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1336  OsmC family protein  30.41 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3515  OsmC family protein  31.58 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1731  OsmC family protein  30.67 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.372414  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  34.45 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06163  hypothetical protein  32.21 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000353  predicted redox protein  30.87 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  36.52 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2253  OsmC family protein  29.66 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0722001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0411  OsmC family protein  29.8 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1947  hypothetical protein  37.74 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1124  OsmC family protein  33.83 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3314  OsmC family protein  30.41 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0548  OsmC family protein  30.94 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474457  normal  0.130238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  27.97 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2411  OsmC family protein  31.93 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.54 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0523786  normal  0.777865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2199  OsmC family protein  28.28 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2177  OsmC family protein  32.8 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1310  OsmC family protein  28.47 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4740  OsmC-like protein  30.71 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0713  redox protein  30.51 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7165  OsmC family protein  29.69 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2114  OsmC family protein  31.15 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0029587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1948  OsmC family protein  29.93 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2165  OsmC family protein  30.94 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000769613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2755  OsmC family protein  33.79 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1958  OsmC-like protein  31.09 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000431204  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5213  OsmC-like protein  34.71 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5646  OsmC family protein  34.71 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0186401  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  30.83 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  29.93 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0455  OsmC family protein  29.66 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2862  OsmC family protein  30.08 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.685422  normal  0.837352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4583  OsmC family protein  31.65 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000769808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5482  OsmC family protein  30.43 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1692  OsmC family protein  27.01 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  29.2 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4927  OsmC family protein  29.71 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2001  hypothetical protein  37.89 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650106  normal  0.0215545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0907  OsmC family protein  28.57 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.055937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1543  OsmC family protein  22.92 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0859  OsmC family protein  34.33 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407191  normal  0.674013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  27.66 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0597  peroxiredoxin, OsmC subfamily  33.58 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145779  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  30.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4367  OsmC family protein  30.84 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2938  OsmC family protein  25.53 
 
 		 228 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  29.13 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3039  OsmC family protein  29.41 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3983  OsmC family protein  30.19 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2167  OsmC family protein  24.8 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  28.26 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2753  OsmC family protein  24.82 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  25.4 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0809  OsmC family protein  21.05 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  25 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  29.51 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  29.51 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  23.65 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>