116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1236 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1236  OsmC family protein  100 
 
 		 172 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1219  OsmC family protein  45.78 
 
 		 147 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1225  OsmC-like protein  44.05 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2730  OsmC family protein  44.71 
 
 		 145 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1234  OsmC family protein  44.12 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.353778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1278  OsmC family protein  44.12 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3079  OsmC family protein  44.12 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.448993  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3409  OsmC/Ohr family protein  43.53 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1145  OsmC family protein  44.12 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1216  OsmC family protein  44.12 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1081  OsmC family protein  43.11 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.192892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1146  OsmC family protein  44.12 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1311  OsmC family protein  43.53 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3312  OsmC family protein  51.59 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2414  OsmC family protein  49.25 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0450  OsmC family protein  42.22 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2693  OsmC family protein  41.18 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393695  normal  0.105076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  42.97 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2718  OsmC family protein  40.27 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1921  OsmC family protein  39.16 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0276475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1165  OsmC family protein  40.62 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06163  hypothetical protein  38.57 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000353  predicted redox protein  38.97 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3388  OsmC-like protein  39.85 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2509  OsmC family protein  39.85 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122372  normal  0.0137293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1351  OsmC family protein  39.85 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0147839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2165  OsmC family protein  42.24 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000769613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2063  hypothetical protein  33.1 
 
 		 155 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  37.4 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1593  OsmC family protein  37.59 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0026  OsmC family protein  39.55 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2253  OsmC family protein  37.31 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0722001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4479  OsmC-like protein  36.17 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1336  OsmC family protein  35.34 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4785  OsmC family protein  37.59 
 
 		 150 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0907  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0383  OsmC-like protein  33.83 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0475  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0173  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1435  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1915  OsmC family protein  37.4 
 
 		 155 aa  90.9  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1846  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2177  OsmC family protein  34.93 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4270  OsmC family protein  37.59 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1731  OsmC family protein  38.17 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.372414  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4637  OsmC family protein  37.59 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1936  OsmC/Ohr family protein  33.08 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2559  OsmC family protein  36.15 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0740791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2411  OsmC family protein  38.79 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1006  OsmC/Ohr family protein  31.58 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3515  OsmC family protein  35 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0411  OsmC family protein  35.34 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3314  OsmC family protein  39.1 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4740  OsmC-like protein  35.07 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1948  OsmC family protein  31.03 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1124  OsmC family protein  36.52 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2862  OsmC family protein  36.15 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.685422  normal  0.837352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1310  OsmC family protein  33.6 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7165  OsmC family protein  32.17 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1947  hypothetical protein  34.68 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  37.5 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2199  OsmC family protein  35.77 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  35.77 
 
 		 357 aa  77.8  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.62 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0523786  normal  0.777865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0548  OsmC family protein  32.46 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474457  normal  0.130238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0455  OsmC family protein  32.54 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  32.84 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  32.85 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1692  OsmC family protein  31.5 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0907  OsmC family protein  32.17 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.055937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2114  OsmC family protein  31.06 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0029587  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5482  OsmC family protein  33.33 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1958  OsmC-like protein  30.23 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000431204  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0713  redox protein  29.77 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4927  OsmC family protein  32.59 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  32.59 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4367  OsmC family protein  29.6 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2001  hypothetical protein  30.6 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650106  normal  0.0215545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3983  OsmC family protein  28.24 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5213  OsmC-like protein  32.84 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5646  OsmC family protein  32.84 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0186401  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4583  OsmC family protein  32.86 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000769808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2938  OsmC family protein  31.93 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2753  OsmC family protein  31.93 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3039  OsmC family protein  28.81 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1543  OsmC family protein  25.15 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2755  OsmC family protein  30.47 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  33.04 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0555  OsmC-like protein  33.02 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000799335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000905109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1268  OsmC-like protein protein  36.36 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0611  hypothetical protein  33.02 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000492756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0556  OsmC-like protein  32.08 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0644  hypothetical protein  33.02 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000573251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  26.61 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0680  hypothetical protein  32.32 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0557  OsmC family protein  32.32 
 
 		 125 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.172009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0701  hypothetical protein  32.08 
 
 		 125 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  27.42 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0773  hypothetical protein  32.32 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000235765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>