91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 		 167 aa  340  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0523786  normal  0.777865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2177  OsmC family protein  58.13 
 
 		 168 aa  191  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0455  OsmC family protein  47.68 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1948  OsmC family protein  54.19 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0713  redox protein  47.02 
 
 		 157 aa  167  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7165  OsmC family protein  50.68 
 
 		 155 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1947  hypothetical protein  50.99 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2862  OsmC family protein  52.9 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.685422  normal  0.837352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1310  OsmC family protein  50.34 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2114  OsmC family protein  52.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0029587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0907  OsmC family protein  51.7 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.055937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2755  OsmC family protein  51.3 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2411  OsmC family protein  49.01 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  45.39 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0548  OsmC family protein  48.08 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474457  normal  0.130238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3039  OsmC family protein  46.36 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  48.99 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4927  OsmC family protein  48.99 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2165  OsmC family protein  49.65 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000769613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5482  OsmC family protein  48.32 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4740  OsmC-like protein  52.38 
 
 		 157 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4583  OsmC family protein  50.99 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000769808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5213  OsmC-like protein  50.33 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5646  OsmC family protein  50.33 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0186401  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1958  OsmC-like protein  47.65 
 
 		 156 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000431204  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1692  OsmC family protein  46.94 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2001  hypothetical protein  48.67 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650106  normal  0.0215545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2938  OsmC family protein  48.3 
 
 		 228 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  48 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2753  OsmC family protein  47.62 
 
 		 200 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4367  OsmC family protein  49.32 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3983  OsmC family protein  47.97 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1124  OsmC family protein  39.46 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1543  OsmC family protein  38.96 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307214  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  40.82 
 
 		 357 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2253  OsmC family protein  42.86 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0722001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1915  OsmC family protein  41.94 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2509  OsmC family protein  40.26 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122372  normal  0.0137293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1351  OsmC family protein  39.61 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0147839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1731  OsmC family protein  40.65 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.372414  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0411  OsmC family protein  40.26 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2718  OsmC family protein  39.04 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1234  OsmC family protein  34.69 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.353778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1278  OsmC family protein  34.69 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1311  OsmC family protein  34.01 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1921  OsmC family protein  40.28 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0276475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2693  OsmC family protein  35.57 
 
 		 164 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393695  normal  0.105076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3079  OsmC family protein  33.33 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.448993  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1081  OsmC family protein  33.56 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.192892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2559  OsmC family protein  36.54 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0740791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4270  OsmC family protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4785  OsmC family protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1336  OsmC family protein  37.5 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1846  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1593  OsmC family protein  37.34 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4637  OsmC family protein  41.22 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3409  OsmC/Ohr family protein  33.33 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0907  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0383  OsmC-like protein  39.6 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0475  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0173  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1936  OsmC/Ohr family protein  39.6 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1435  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0450  OsmC family protein  34 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4479  OsmC-like protein  37.75 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3312  OsmC family protein  35.2 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3388  OsmC-like protein  37.11 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1216  OsmC family protein  33.33 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2414  OsmC family protein  37.3 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2730  OsmC family protein  34.92 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2063  hypothetical protein  34.72 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1145  OsmC family protein  32.65 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1006  OsmC/Ohr family protein  38.26 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1146  OsmC family protein  31.97 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1225  OsmC-like protein  31.51 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0026  OsmC family protein  37.09 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1165  OsmC family protein  37.41 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1219  OsmC family protein  28.78 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06163  hypothetical protein  35.42 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3515  OsmC family protein  40.94 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  38.26 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000353  predicted redox protein  34.03 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1236  OsmC family protein  33.62 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3314  OsmC family protein  37.33 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  32.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2199  OsmC family protein  34.64 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0809  OsmC family protein  27.27 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  26.95 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.34 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0814  OsmC family protein  30.16 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>