More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0334 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0334  OsmC family protein  100 
 
 
141 aa  287  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  56.43 
 
 
142 aa  167  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3323  OsmC family protein  55.15 
 
 
142 aa  158  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800785  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  50.71 
 
 
142 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  51.85 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2792  OsmC family protein  49.29 
 
 
142 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000166944  hitchhiker  0.0000110677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  45.26 
 
 
141 aa  135  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  46.04 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.93 
 
 
142 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  44.44 
 
 
142 aa  123  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  45.93 
 
 
141 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  48.91 
 
 
146 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  46.32 
 
 
141 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  45.45 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.55 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  41.48 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  41.48 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  45.52 
 
 
140 aa  116  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.78 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  45.59 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  43.38 
 
 
140 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  43.38 
 
 
140 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  45.86 
 
 
141 aa  114  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  43.38 
 
 
140 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  41.84 
 
 
142 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  44.12 
 
 
140 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  42.45 
 
 
141 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  44.12 
 
 
140 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  44.78 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  46.15 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  43.28 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  43.28 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  43.48 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  43.28 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  41.18 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  42.65 
 
 
141 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8688  OsmC family protein  44.53 
 
 
137 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  43.48 
 
 
140 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  43.07 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  42.22 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  42.54 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  42.54 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  42.75 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  42.54 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  42.25 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  41.3 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  43.28 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000950914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  41.91 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0240  OsmC family protein  47.41 
 
 
139 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  43.41 
 
 
141 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  44.44 
 
 
141 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1298  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  43.38 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  39.86 
 
 
142 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  43.94 
 
 
138 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  43.38 
 
 
140 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0833  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.55 
 
 
147 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  45.45 
 
 
143 aa  105  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  42.96 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  41.48 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  39.86 
 
 
142 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  41.48 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  41.3 
 
 
140 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  44.53 
 
 
142 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  42.96 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  44 
 
 
139 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  39.86 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  39.86 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  41.48 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  41.3 
 
 
140 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  41.18 
 
 
139 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  41.18 
 
 
139 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  42.86 
 
 
142 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  41.18 
 
 
139 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  41.18 
 
 
139 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  41.18 
 
 
139 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  42.65 
 
 
139 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  40.58 
 
 
140 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  47.1 
 
 
141 aa  103  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  41.18 
 
 
141 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  44.09 
 
 
141 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  39.86 
 
 
142 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  40 
 
 
139 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1675  OsmC family protein  40 
 
 
139 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>