More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3323 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3323  OsmC family protein  100 
 
 
142 aa  287  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800785  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  64.23 
 
 
142 aa  194  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  61.15 
 
 
142 aa  188  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0334  OsmC family protein  55.15 
 
 
141 aa  158  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2792  OsmC family protein  59.85 
 
 
142 aa  153  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000166944  hitchhiker  0.0000110677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.81 
 
 
142 aa  147  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  55.3 
 
 
140 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  55.3 
 
 
140 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  55.3 
 
 
140 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  51.8 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  50.38 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  56.2 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  54.55 
 
 
139 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  52.17 
 
 
141 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  52.86 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  50.37 
 
 
142 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  42.55 
 
 
141 aa  134  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  48.06 
 
 
141 aa  133  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  52.94 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  47.86 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  51.11 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  51.47 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  50.76 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  50 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  51.47 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  52.71 
 
 
141 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.27 
 
 
139 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3872  organic hydroperoxide resistance protein OhrB, OsmC family  54.68 
 
 
136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  52.27 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  49.28 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  49.28 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  49.26 
 
 
141 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  49.26 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  47.48 
 
 
140 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  47.48 
 
 
140 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  51.13 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  48.55 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  50.38 
 
 
190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  48.55 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  50 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  51.52 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  50 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  53.91 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.59 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  53.28 
 
 
140 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  46.76 
 
 
139 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  46.76 
 
 
139 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  46.72 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  46.76 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  46.76 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  50.75 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  46.76 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  47.79 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3499  OsmC family protein  50.38 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3622  OsmC family protein  50.38 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.867259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3427  OsmC family protein  50.38 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  47.79 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  50.35 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  50.37 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  48.44 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  50.39 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  48.15 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  51.13 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  46.04 
 
 
139 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  50 
 
 
141 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  46.04 
 
 
139 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0833  peroxiredoxin, Ohr subfamily  51.49 
 
 
147 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  50.39 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  50.39 
 
 
142 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0814  OsmC family protein  49.62 
 
 
141 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000492477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  48.15 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  44.27 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  46.67 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  50.39 
 
 
141 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  48.94 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  48.23 
 
 
142 aa  123  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2314  OsmC family protein  44.53 
 
 
140 aa  123  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.52 
 
 
140 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  50.39 
 
 
142 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  43.51 
 
 
138 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  47.06 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  43.51 
 
 
138 aa  121  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  50.76 
 
 
142 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  53.03 
 
 
142 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3312  OsmC family protein  48.85 
 
 
141 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8688  OsmC family protein  47.1 
 
 
137 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  47.79 
 
 
141 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0865  OsmC family protein  49.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  44.85 
 
 
140 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3057  OsmC family protein  47.33 
 
 
141 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>