41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3747 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2833  OsmC family protein  66.22 
 
 		 158 aa  203  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  hitchhiker  0.00176763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49110  redox protein  57.05 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2284  OsmC family protein  54.93 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1205  OsmC family protein  53.38 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274132  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1365  OsmC family protein  53.38 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1144  OsmC family protein  50.7 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3777  OsmC family protein  49.65 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4182  OsmC family protein  42.57 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0042  OsmC family protein  47.1 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1521  hypothetical protein  46.98 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483941  normal  0.516484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2200  OsmC family protein  47.97 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4658  hypothetical protein  27.13 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  hitchhiker  7.91751e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.13 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0680  hypothetical protein  27.13 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0701  hypothetical protein  27.91 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0556  OsmC-like protein  27.91 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0557  OsmC family protein  27.13 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.172009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0611  hypothetical protein  27.13 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000492756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0644  hypothetical protein  27.13 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000573251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0555  OsmC-like protein  26.36 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000799335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0773  hypothetical protein  27.13 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000235765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  24.17 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0432  OsmC-like protein  30.48 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  28.12 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  31.19 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0712  hypothetical protein  26.36 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000905109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  49.06 
 
 		 413 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1183  hypothetical protein  47.92 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  24.6 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  26.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  29.47 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  28.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  21.3 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1564  OsmC family protein  32.85 
 
 		 146 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  28.26 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  29.7 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  26.79 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0525  OsmC family protein  26.13 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  29.7 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  27.19 
 
 		 139 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>