41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0349 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  100 
 
 
163 aa  327  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  33.11 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.79 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  29.91 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  34.82 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.91 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  36.96 
 
 
135 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  32.46 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  30.19 
 
 
177 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.05 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  36.36 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  36.36 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  33.02 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  36.36 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  34.31 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.28 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  33.01 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  35.35 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  35.35 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  32 
 
 
407 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  29.17 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.6 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  30.38 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  26.95 
 
 
406 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  31.37 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  33.33 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  24.8 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  27.78 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  33.33 
 
 
169 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  27.78 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  27.78 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  32.14 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  27.78 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  26.6 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.05 
 
 
407 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  27.78 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  29.32 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  23 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.2 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  27.78 
 
 
130 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>