77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0330 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  100 
 
 		 169 aa  340  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  99.41 
 
 		 169 aa  337  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  95.27 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  87.43 
 
 		 169 aa  298  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  81.66 
 
 		 169 aa  290  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  80.36 
 
 		 169 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  77.98 
 
 		 168 aa  273  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  72.02 
 
 		 169 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  72.62 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  72.02 
 
 		 169 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  70.83 
 
 		 169 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  63.47 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  64.85 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  64.88 
 
 		 169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  62.96 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  52.73 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  54.32 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  48.48 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  49.07 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  45.68 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  45.45 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  36.08 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  36.36 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  26.95 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  35.42 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  37.76 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  30.39 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  30.68 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  30.21 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  28.36 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  29.85 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  28.04 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.78 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.68 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  31.82 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.7 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  28.85 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  33.68 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  36.36 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  29.19 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  38.1 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  29 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  29.47 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  29.75 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  23.91 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  30.53 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  33.78 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  28.92 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  28.92 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  28.92 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  32.69 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  28.92 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  28.92 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  31.91 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  32.69 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  32.43 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  32.43 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.22 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  31.43 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  27.37 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  28.42 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  27.06 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.57 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  25.56 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  28.42 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1013  OsmC family protein  25.66 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  29.17 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  30.68 
 
 		 144 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  30.77 
 
 		 185 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  29.73 
 
 		 187 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  30.88 
 
 		 74 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  28 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>