46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1477 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  54.81 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  34.29 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.21 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.78 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  30.88 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.29 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  32 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  28.72 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  40.28 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  40.28 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  28.97 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  26.47 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  24.65 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  31.63 
 
 		 180 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.63 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  29.23 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  28.28 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  30.56 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  25.66 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  25.66 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  22.22 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  31.65 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  31.94 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  31.65 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  29.17 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  29.55 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  36.25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  26.26 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  26.67 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  25.47 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  28.95 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  28.87 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  25.49 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  26.32 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  25.89 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  28.97 
 
 		 199 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  25.98 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  30.56 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  24 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  27.03 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  29.55 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  29.52 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  27.48 
 
 		 169 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  25.49 
 
 		 176 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>