86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0304 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  73.3 
 
 		 208 aa  288  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  74.42 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  66.67 
 
 		 176 aa  239  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  65.91 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  58.38 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  58.93 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  57.3 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  60.59 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  61.29 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  58.24 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  42.16 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  42.37 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  41.81 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  42.31 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  41.81 
 
 		 183 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  44.55 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  36.62 
 
 		 145 aa  85.5  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  37.04 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  37.3 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  41.07 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  40.37 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  37.17 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  41.07 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  36.36 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  32.78 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  39.47 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  38.6 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  41.07 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  37.33 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  37.33 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  46.74 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  46.74 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  46.74 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  35.34 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.18 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  37.61 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  39.32 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  36.84 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  33.61 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  38.94 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.17 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  32.89 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  34.26 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  35.04 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  45 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  25.85 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  30.51 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  37.07 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.51 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  32.48 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  32.14 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  35.83 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  34.82 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  32.41 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  27.34 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.99 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  31.18 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.09 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.53 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  34.02 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  33.68 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  33.68 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  28.29 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  32.99 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  33.68 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  30.09 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  28.18 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  31.03 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  30.77 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  30.67 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  28.7 
 
 		 142 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  30 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  25.23 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  26.24 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  26.24 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  26.24 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  34.72 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  26.24 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  26.96 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  26.96 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  30.53 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  30 
 
 		 168 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  28.83 
 
 		 138 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  27.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>