71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2855 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  100 
 
 
169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  66.47 
 
 
169 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  66.07 
 
 
169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  65.87 
 
 
169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  64.85 
 
 
169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  64.85 
 
 
169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  64.24 
 
 
169 aa  210  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  66.25 
 
 
168 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  62.5 
 
 
169 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  67.35 
 
 
168 aa  203  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  62.65 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  60.24 
 
 
169 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  62.05 
 
 
169 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  59.64 
 
 
169 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  58.43 
 
 
169 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  55 
 
 
167 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  55 
 
 
167 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  51.83 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  54.78 
 
 
167 aa  140  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  49.38 
 
 
168 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  46.88 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  39.77 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  36.73 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.33 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  30.08 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  27.63 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  30.97 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  31.62 
 
 
206 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  33.33 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  32.29 
 
 
202 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  28.47 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  32.97 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  34.21 
 
 
182 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  34.65 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  28.57 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  29.17 
 
 
171 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  29.55 
 
 
202 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  32.54 
 
 
185 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  28.57 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  27.78 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  33.33 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  34.09 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.82 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  27.45 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  35.04 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  31.25 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  33.01 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  30.09 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  31.19 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.68 
 
 
181 aa  47.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  24.32 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  32.53 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  32.53 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.67 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  28.83 
 
 
183 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  30.1 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  23.64 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2951  OsmC-like protein  34.29 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000581038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  25.71 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  27.93 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  30.61 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  30.77 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  27.93 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  28.85 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  36.84 
 
 
74 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  28.75 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  27.93 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  27.14 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  29.49 
 
 
174 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.83 
 
 
145 aa  40.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>