68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0781 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  100 
 
 
169 aa  332  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  65.27 
 
 
169 aa  220  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  64.07 
 
 
169 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  63.47 
 
 
169 aa  218  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  65.85 
 
 
169 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  66.67 
 
 
169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  66.67 
 
 
169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  66.87 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  62.05 
 
 
168 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  65.06 
 
 
169 aa  208  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  62.5 
 
 
169 aa  205  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  65.56 
 
 
168 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  64.46 
 
 
169 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  63.41 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  62.05 
 
 
169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  59.26 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  51.5 
 
 
167 aa  163  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  48.17 
 
 
167 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  49.09 
 
 
167 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  44.12 
 
 
153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  46.91 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  34.85 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  34.86 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  35.34 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  34.65 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  27.81 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.59 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  35.96 
 
 
189 aa  60.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  27.74 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.25 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  33.57 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  31.9 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.94 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.56 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  33.02 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  27.19 
 
 
193 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.67 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  31.19 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  32.65 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  31.48 
 
 
181 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  30.38 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  30.69 
 
 
202 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  32.08 
 
 
185 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  30.23 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.59 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  30.57 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  32.32 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  29.87 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  32.99 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.63 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  31.31 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  24.78 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  28.74 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  34.38 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  25.51 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  32 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  25.51 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  28 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  26.97 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  26 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  26.09 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  26.09 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  33.33 
 
 
163 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.72 
 
 
187 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  28.68 
 
 
190 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  24.55 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  24.55 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>